第 1 季

高中一年级学生桃宫莓，是个憧憬恋爱、活泼开朗的女孩。对学校第一人气人物青山雅也一见钟情的莓，鼓起勇气邀请青山约会。然而，在前往的“红色数据动物展”上发生了紧急情况。被突然释放的耀眼光芒包围的莓，竟然变成了正义的伙伴“小莓猫猫”！一定要保护好最喜欢的青山和地球的未来！作为谢礼会好好服务喵♡

白金棱和赤坂圭一郎请求莓，为了从外星人手中保护地球，希望她参加“μ”计划。莓开始在作为据点的猫猫咖啡厅打工，同时和蓝泽薄荷一起寻找剩下的伙伴。某天，莓在咖啡厅遇到了一位温柔的少女碧川莴苣，想和她成为朋友。但莴苣似乎有什么烦恼——。此时，莓和薄荷推测她们听到传闻的怪奇现象是奇美拉动物所为。赶到学校泳池后，她们看到的是…！？

作为上次约会的雪耻！莓和青山雅也来到了动物园。一开始两人都很紧张，本以为好不容易气氛变好了，结果……像猴子一样表演街头杂技、活力满满的女孩黄步铃（Fon Purin）登场了！难得的约会被打扰，莓正感到沮丧时，自称“奇修”的外星人出现，陷入大危机。救了莓她们危机的新伙伴是，布丁猫猫！

第5位东京猫猫终于找到了！她是如今极具人气的艺人，兼具冷艳美貌和出众身材的 charismatic·藤原石榴。也是薄荷一直憧憬的人。为了接触石榴，莓、薄荷、莴苣三人决定参加石榴主演的音乐剧的选拔。然而，因年龄限制无法参加、本该一个人留守的步铃突然闯入，选拔变得一团糟！能顺利让石榴成为伙伴吗！？

看到因石榴的一句话而彻底消沉的薄荷，莓等人来到薄荷的豪宅，想方设法让她振作起来。最初薄荷想把她们赶走，但发生了意外让她们浑身湿透，还玩起了枕头大战，4人闹成一团！薄荷谈论着自己的梦想，和大家说了很多话，恢复了精神，决心再去见石榴一次。然而此时奇修出现了——。

听闻奇修计划袭击石榴，莓、薄荷、莴苣、步铃前往电视台保护她。她们尝试了各种变装，好不容易成功潜入！莓等人与重逢的石榴接触，说服她成为东京猫猫的伙伴。然而，原本应该最想和石榴在一起的薄荷，却对石榴说出了类似告别的话。目睹东京猫猫勇敢迎击敌人袭击的石榴……

东京猫猫终于全员到齐。石榴也开始打工，猫猫咖啡厅变得非常热闹！另一方面，外星人那边，由冷酷的派和像捣蛋鬼一样的蛋挞两人，取代了接连失败的奇修，向和青山雅也在一起的莓发动攻击。在突然不合时节地盛开的樱花中，莓和青山遭到奇美拉动物的袭击。为了守护青山，莓想变身成东京猫猫，却担心真实身份会暴露……

白金棱拥有的豪华客船上，将举办赤坂圭一郎的新甜品发布会。东京猫猫们，以及步铃的弟弟妹妹们也都盛装登船！华丽的派对开始了。莴苣想为大家做更多贡献而干劲十足，却总是失败，白忙一场。白金留意着这样的莴苣。此时，派放出的奇美拉动物发动袭击，步铃的弟弟被掳到了海里。不会游泳的莴苣虽然犹豫，但除了自己没有别人能救他……

青山雅也拿到了两张演唱会门票。他想邀请莓，但一直说不出口，结果莓已经去打工了。今天猫猫咖啡厅也是客人满满，非常忙碌！打工、上学，还有作为东京猫猫活动。每天忙得没时间和青山见面，莓感到有些寂寞。就在这时……青山竟然出现在了猫猫咖啡厅！察觉到青山想送出门票的薄荷等人，决定为两人助一臂之力。

明天就是和青山雅也的约会了。莓非常期待，但有一件事让她担心。那就是，自己正在逐渐猫化。而且今天又差点在青山面前变成猫，慌忙逃走。猫莓被孩子们追赶、被巨大猫咪弗朗索瓦逼近，最后甚至掉进了河里！在千钧一发之际救了猫莓的是——

外星人们开始了“TOKYO大陆复古（东京冈瓦纳复兴）”作战。与此同时，探测到能够净化世界的超物质·Mew Aqua的白金等人，在不知道莓身在何处的情况下，不得已派薄荷、莴苣、步铃、石榴前往东京塔。另一方面，仍然保持猫形态的莓从青山家跑出来后，独自在街上徘徊。得知薄荷等4人身陷危机，白金拼命寻找莓的行踪——。

莓终于赶到，东京猫猫5人齐心协力，迎战奇修等外星人的最终决战。然而，从巨大虫茧中诞生的生物“尘埃飞龙”释放的污染物质覆盖了天空，东京陷入恐慌。此时，青山雅也在约定的地方，等待着过了时间还没来的莓。在混乱的街道中，青山通过影像看到了战斗中的东京猫猫的身影——。

借助Mew Aqua的力量，东京猫猫5人成功将东京从污染中拯救出来。而且，莓与青山雅也心意相通，终于如愿以偿地两情相悦！得到了薄荷她们、美和&萌，还有爸爸妈妈的祝福，幸福满满的莓，决定周末和青山一起帮忙水族馆的儿童活动。活动当天，一边做志愿者一边享受约会气氛的莓，奇修却在此刻出现……？

在小莓猫猫危急时出现的神秘帅哥，苍之骑士。他究竟是什么人……？莓正在思考时，薄荷突然来家里拜访。薄荷好像是因为被家人当作小孩对待而生气，正在离家出走中！？薄荷为了向誓司他们证明自己已经不是小孩子了，正拼命思考着风力发电的商业企划。莓她们齐心协力支持薄荷的实验！

迎来生日的弟弟妹妹们，要和步铃一起去东京巨蛋看马戏团表演。那个马戏团，对于步铃的爸爸和去了天堂的妈妈来说，是个重要的地方。非常热爱家人的步铃，很期待能看到演出，比平时更加活力满满！但此时，外星人们正准备启动“TOKYO大陆复古”作战的第二阶段。其目标竟然是东京巨蛋……⁉

在游轮派对上被白金鼓励后，莴苣的表情逐渐变得开朗起来。此时，有情报称海洋博物馆可能有类似Mew Aqua的东西，莴苣便和白金两人前去确认真伪。莴苣一边隐藏着内心的悸动，一边调查古代的耳环。但就在这时，奇修出现在两人面前！受到攻击的莴苣掉入海中，被海浪卷走了……。当莴苣醒来时，发现自己身处——？

石榴决定自编自导自演新歌的MV！莓她们也一起出演！担任导演的是被称为天才影像作家的石榴的同班同学皆川理香。两人之间似乎有过节？拍摄开始后，理香接连提出无理要求。石榴完美地回应了所有指示，但理香似乎并不满意，两人激烈地互不相让。然而，当轮到莓她们出场时，两人的表情发生了变化……？

苍之骑士的真实身份，竟然是白金棱⁉ 受到冲击的莓大受打击。赤坂圭一郎向她讲述了白金的过去。那是与“μ（Mew）”计划开端相关的，悲伤而心酸的故事……。另一方面，薄荷为了参观誓司公司的新产品，来到了东京湾。她对能够全自动清扫海中垃圾的划时代机器感到钦佩，但此时派的魔手正在逼近——！

东京猫猫5人顺利收集着Mew Aqua。然而外星人们的攻击并未停歇，战斗愈演愈烈。在这样的情况下，最近没能和青山约会的莓计划了一次午餐约会！她从妈妈那里得到建议，用心制作了充满爱意的便当。青山开心地吃完了便当，两人享受了久违的幸福时光。但是，一个巨大的考验即将降临到这样的莓她们身上……

莓向青山雅也坦白了自己是小莓猫猫的事，没有了秘密让她感到无比幸福。但青山似乎因为担心莓而陷入了沉思？另一方面，在与苍之骑士的战斗中察觉到某事的奇修，与派、蛋挞一起开始迅速行动。遭到外星人急袭的东京猫猫们陷入混乱。莓被奇修掳走，陷入巨大危机！当奇修对着莓倾泻他满溢的思绪时，有一位人物赶到了两人身边。

击败袭击猫猫咖啡厅的奇美拉动物后，莓等人为了净化覆盖东京上空的云层，开始寻找Mew Aqua。她们依靠石榴的感应，在地下水道进行搜索。但挡在面前的外星人似乎在策划着什么……？另一方面，被关在蓝泽家的薄荷说服了誓司，打算去阻止派所失控的大气净化系统。然后，因奇修的话而心绪不宁的苍之骑士=青山雅也——？

莓在眼前受到伤害的冲击，让苍之骑士=青山雅也作为外星人的救世主“深蓝”觉醒。目睹这一幕的莓因过度冲击而眼前发黑……薄荷等4人为了守护地球的未来，决心与外星人战斗，但被想要保护青山的强烈念头驱使的莓，却将那份力量对准了伙伴——？此刻，东京猫猫的羁绊面临考验！

东京猫猫与外星人的最终决战终于拉开帷幕！莓将与派和蛋挞的战斗托付给薄荷、莴苣、步铃、石榴四人，独自赶往蓝影者所在之处。这是为了找到Mew Aqua守护地球的未来，也为了再一次和青山对话——。然而，蓝影者却冷漠地推开了这样的莓。但就在这时，奇修闯入两人之间！他也有着想要守护的“重要之物”……

最后的“Mew Aqua”竟然在青山雅也的身体里！蓝影者企图利用Mew Aqua的力量，将母星的居民召唤到地球并毁灭人类。莓拼命向他诉说，希望创造一个人类与外星人共存的未来。这时，蓝影者体内青山的心产生了变化……？东京猫猫与外星人漫长而激烈的战斗终于迎来结局！地球的未来究竟会如何呢⁉