第 1 季

令国土管理室沮丧的是，国木田枫突然消失了。与此同时，女学生富士山红叶被一个执意要杀死她的奇怪男人袭击。但她为何被盯上？幸存下来的红叶，发现学校充满了怪物，但最奇怪的是，人们认为她是某种“公主”。

一个名叫草薙护的男人出现，让可怜的红叶更加困惑，但当她知道他是来保护她免受这些奇怪怪物伤害时，她感到更安全了。但她不知道，护尚未决定是拯救她还是牺牲她。与此同时，国土管理室带着可能击败可怕荒神的实验性造物赶往现场。

被送往东京后，成为荒神目标的红叶发现她现在由国土管理室照料。她知道这些怪物是可怕、邪恶的东西，真的很想帮忙，但不知道如何做起。国土管理室很快发现他们的基地并不安全，一只荒神闯入并发动了攻击。

严守规则的国土管理室成员泽口小梅，对被迫照看团队最新成员红叶感到愤怒。很快团队发现，红叶的蓝色种子可以追踪荒神，而可怕的事情可能即将发生。

当松平夫人将红叶视为可随意实验的活体标本时，草薙护感到愤怒。就在红叶准备就草薙护对那位夫人及其儿子的威胁进行对质时，一只奇怪的水母从东京湾出现，事态升温。

国土管理室成员八景觉得其他人似乎贡献更多，自己不被需要。当好心的红叶试图帮忙时，她发现了关于他的一些她宁愿不知道的事情。在试图帮助八景重拾信心后，两人出发追踪一只荒神。

愤怒的红叶出发去营救一个被绑架的小女孩。不幸的是，女孩的父亲是一个研究过枫的男人，绑架者要求额外的材料……一种能帮助荒神防御红叶的材料。红叶的决心面临考验。

刚刚从美国回来的巫女樱，将红叶视为敌人。樱因此向红叶发起唱歌挑战——地点在一个发生过多次荒神袭击的演播室。一场出乎意料的较量在音乐中展开。

可怕的东京被变异犬跟踪，但国土管理室和他们的朋友草薙护没有采取任何行动消灭它们。很快团队发现它们被神秘杀死，为了抓住狗和杀手，草薙护带红叶出去，告诉她这是一次约会，殊不知这是一个拯救东京的计划。

又一个荒神恐吓东京，这次是一只盯上地铁系统的喷火青蛙。当红叶对抗荒神时，她遇到了几乎终结她生命的邪恶男人村云。草薙护及时赶到，进行了她认为是“一个吻”的人工呼吸，并与村云展开对决。

当樱转学到红叶的学校时，她感到惊恐，更糟糕的是，她发现樱和她爱慕的草薙护在一起消磨时间。与此同时，红叶学校的女孩们接连被发现死亡，血液被吸干。这简直是雪上加霜！

可怜的红叶在学校和国土管理室的工作间疲于奔命，但当她受伤的爱人出现在窗外需要治疗时，她高兴地将他带回家中。与此同时，国土管理室调查一种习惯缠绕摩天大楼并留下恶心表皮的奇怪蜈蚣。

国土管理室决定给陷入爱河的红叶提供约会建议和告白技巧，但一切都不顺利。她被叫去见证荒神须佐之男的重生以及她姐姐枫的回归。个人情感与世界危机同时降临。

当枫和村云带着须佐之男逃离时，全日本的树木开始枯萎死亡，引发全国哗然。在奈良度假区，一种新型荒神通过散播有毒花粉污染空气来肆虐大地。沮丧的红叶、分心的八景和国土管理室团队用最新发明出发摧毁花粉怪物。

团队前往乡村调查再次出现的河童海怪，与此同时，红叶对枫的一位同学的话感到困扰。像枫那样完美的存在，怎么可能被她打败？她如何才能赢！？信心在旅程中动摇。

国木田出发调查老友之死，接待他的是年轻却隐藏致命秘密的遗孀。与此同时，畸形尸体开始堆积，关于“千年尼姑”（通过吞食人鱼肉保持青春的女子）的目击报告不断出现。悲伤的传说在风景如画之地蔓延。

沮丧的国木田沉迷工作，美丽的竹内试图帮助他却未能完全安抚他。与此同时，红叶和草薙护都担心即将举行的、会增强须佐之男力量的仪式。情感如同暴风雪般在内心席卷。

须佐之男的力量扰乱了强大的荒神“野槌”，樱的过去因此被揭开——野槌在很久以前杀死了她的母亲。红叶与国土管理室赶来援助樱，却无力阻止野槌吞下樱。在怪物腹中，樱惊恐地发现——她的母亲还活着。

强大的枫用能量穹顶笼罩了一座废弃城市，进入查探的草薙护被困其中，红叶紧随其后进入救援。然而，草薙护逐渐被白日梦般的幻象控制，红叶发现自己难以拯救他。在虚幻与现实的交界，爱与羁绊面临考验。

怪物目击报告和巨型植物出现的投诉让国土管理室忙得不可开交，国木田前往出云调查。红叶找到了母亲萌，却开始思念正在与须佐之男、枫和村云战斗的草薙护。新的线索指向神话的起源地。

战斗持续，红叶的母亲与国木田最终对峙枫和须佐之男。与此同时，红叶和亮子找到正在战斗的草薙护，但未来得及援助，他就被村云击败。面对重要之人的倒下，分离的悲伤与危机同时降临。

为拯救日本免受日益严重的荒神侵扰，首相无奈决定牺牲红叶。仍在为草薙护之“死”悲伤的红叶接受了命运。但国土管理室并未放弃，竹内和小梅前去营救。起初红叶拒绝，认为这是她的宿命，直到竹内一耳光打醒她，让她想起战斗的意义。三人最终在樱及其粉色海洋生物的意外帮助下逃脱。离开时，红叶的御魂开始发光，她感知到了草薙护！

红叶与国土管理室在樱的公寓避难，以争取时间寻找应对荒神的方法。樱证实了国木田的猜测：根据条约，美国在日本政府正式求援前无法介入。然而村云突然出现，八景为保护小梅受伤，红叶被村云掳走。村云将红叶带至枫与须佐之男所在地，想利用红叶对付枫，但被草薙护打断。一场激战爆发，枫救下红叶，但其“御魂”丢失（后被草薙护找回）。存放须佐之男巨大御魂的地方开始剧烈震动……

草薙护拜访首相并转交了国木田的特殊包裹——一部手机。国木田试图说服政府官员，国土管理室能在不牺牲红叶的前提下消灭荒神。首相透露，红叶的照片是被政府内的荒神间谍泄露的。与此同时，日本陷入混乱，火山喷发、植物疯长，民众要求拘禁红叶。关于“奇稻田脉冲”的研究取得进展，发现红叶与枫产生共鸣的奇异旋律是关键。红叶回忆起枫提过的“祭”仪式，要求被带往仪式举行地。

决战黎明，国土管理室准备最后的战斗，红叶则为“祭”的仪式做准备。日食前一小时，枫用剑触碰须佐之男周围的力场，邪神开始变异成丑恶的巨兽。首相最终选择向国民坦白真相，告知荒神的存在与红叶是唯一能阻止它们的人。红叶通过电视请求国民给她一个机会尝试新方法，若失败她将接受牺牲的命运。仪式开始，红叶的命运将迎来最终裁决。

巨大的荒神花苞绽放，导致“御魂”如雨般坠落地球，所有被触碰的人都将化为植物。红叶在“奇稻田脉冲”的冲击下痛苦嘶喊，姐姐枫却认为“为时已晚”，为保护须佐之男而融入其御魂。尽管村云试图吸取须佐之男的力量，却最终自取灭亡。全日本的孩子们开始和红叶的歌声共鸣合唱，国土管理室的成员们感受到温暖与幸福，红叶的仪式即将完成……