第 2 季

鱼神岛上，咸鱼哥因弄坏鱼神像被姨妈逼去修复，偶遇天界愿望部长祁望三人组——他们为追查失窃的神牌位来到人间，却因没钱租房陷入窘境。两人为各自目标（咸鱼哥想买口红赔罪，祁望需赚房租）被迫合作抓捕会下蛋的网红公鸡，与疯狂争抢的村民展开爆笑混战。最终虽用鸡蛋修好神像，却因乌龙再度毁坏。祁望发现神像竟是旧识鱼神，决定留岛继续调查，而幕后黑手小海悄然现身……

校长儿子占林子因长期被父亲苛责"必须考第一"而焦虑，偷改试卷时偶遇咸鱼哥（扮女装找假发）和周名轩（找游戏机）。三人争执中，咸鱼哥点破校长严苛教育的矛盾。最终占林子未改成绩却意外与周名轩并列第一，首次获得父亲认可。同时，小海离岛暗示其"转变海妖命运"的阴谋，咸鱼哥因暴露男装被虾伯开除，流落街头。

漫画家璃因《鸳鸯江湖情》意外走红，被经纪人卡蚌卡邀请去鲸鱼市办画展。尽管恐惧外界评价，她在咸鱼哥鼓励下离岛追梦。画展当天，璃发现观众追捧的竟是作品的"丑"，卡蚌卡利用她制造流量。心碎的璃在嘲讽声中离场，却握紧画笔走向未知森林，暗示她将重拾初心。

璃在画展上遭遇观众嘲笑和卡蚌卡的背叛，心灰意冷时被咸鱼哥、老泥鳅救场。夺回原稿后，她拒绝返回鱼神岛，决定继续闯荡江湖追寻漫画梦想。结尾璃迎着朝阳独自远行，咸鱼哥望着她的背影，仿佛看到漫画中那位勇敢的女侠。

薇薇安节目上揭露男嘉宾丑行，彩凤在鱼神岛遇流浪猫詹妮弗，发现其是薇薇安的猫。归还时，薇薇安嫌弃詹妮弗丑，彩凤怒怼并带走猫，还与薇薇安发生冲突，最后成功逃脱。期间祁望等人在鱼神岛调查案件，线索指向鱼店却无果。

祈望计划抓捕盗取鱼神牌位的小偷，却遭遇小海。一番激战后，祈望不敌，小海逃脱。回忆中，少年祈望遇鱼神，得知其代替冥望接管愿望部。现实里，溺水的祈望被咸鱼哥等人救起，祈望想起与大海妖战斗的过往，那时的他也曾被凡人救助。

祈望溺水后被咸鱼哥等人救起，昏迷中回忆起少年时与冥望斩妖除魔的过往，还有南天门的创立及变故，冥望牺牲后南天门模式改变。醒来后祈望与咸鱼哥交谈，受其影响，开始思考享受人生。同时小海发现三叉戟不受控，察觉到牌位与咸鱼哥有关 。

周明轩一直逃避游泳课，因其不会游泳，在某次游泳课上暴露。为应对下周考试，他求咸鱼哥教自己，可众人教学方法皆不适用。最后周明轩在救旺财时突破自我，成功学会游泳，原来旺财是他幼时溺水被救后收养的猫。

女明星莎莎因番位被 Momo 酱取代，还遭记者穷追猛打，逃到鱼神岛。在岛上，莎莎向咸鱼哥、小海倾诉困境，她因年龄、出身被舆论困扰，担心失去自我。此时 Momo 酱趁机宣布独自出演，莎莎决定回剧组，还要求咸鱼哥和小海同行。

莎莎回剧组与 Momo 酱展开舞台剧争夺，咸鱼哥和小海帮忙。演出中状况百出，Momo 酱原形毕露，众人齐心协力对抗。最终莎莎获胜，找回魅力，咸鱼哥和小海告别。小海回家却发现父亲因尾巴被发现受伤，这让他陷入痛苦与震惊。

鲸鱼市老人因 “妖怪” 字样被打，专家称海妖或存。小海向咸鱼哥袒露身份，想让其成鱼神再打败他，以扭转海妖命运。虾伯向咸鱼哥讲述海妖过往，小海因妖怪身份从小饱受歧视，大学时身份暴露，还连累父亲被打，这促使他决心改变现状。

小海因海妖身份在学校饱受孤立，想当鱼神改变命运却失败，后在鱼神岛打工发现神牌位对咸鱼哥有反应，便想让咸鱼哥成鱼神再打败他。此时鱼神岛突发台风，众人前往学校避难，祈望等人赶来，咸鱼哥为阻止小海，尝试解开神牌位密码。

咸鱼哥为救众人接受鱼神考验，回忆起儿时因与大家不同被视为怪人，在母亲开导下明白要做特别的自己。来到鱼神岛后，他收获温暖与认可。最终咸鱼哥领悟，重要的是成为特别的自己去保护大家，通过考验，准备直面小海。