第 1 季

与父亲生活在丛林中，苦练武艺立志成为天下第一武士的少年——铁刃。某天因缘际会来到了陌生的现代日本都市。命运的邂逅、宿命的对决，从这一刻拉开序幕

为了与鬼丸一决胜负，铁刃千方百计试图引起他的注意。然而鬼丸却始终无动于衷。直到从丛林追来的秃鹫・庄之助毁坏了鬼丸珍视的鸽舍，这场冲突终于爆发。被铁刃胡乱挥舞的剑招羞辱后，鬼丸在羞愤交加中失手砸碎了家中的石灯笼。不料这一举动竟意外显露出通往地下室的阶梯，以及一柄封印其中的——魔剑・风神剑。

这次，鬼丸向铁刃发起了挑战。面对双角显现、形态异于平常的鬼丸，铁刃虽心生违和，仍燃起战意迎击。然而手持风神剑的鬼丸展现出压倒性力量，令铁刃深刻意识到自身弱小。从父亲剑十郎处得知，欲抗衡鬼丸须取得另一柄魔剑——雷神剑。为此，铁刃奔赴天狗岳，求见雷神剑现任持有者、传说中存活四百年的剑豪・宫本武藏。

铁刃虽然获得了雷神剑，但被雷神之力反噬而暴走。为了能够自如驾驭雷神剑，铁刃跟随武藏开始了修行。另一边，鬼化的鬼丸通过仪式创造出八鬼，先是袭击国会大厦企图掌控日本政权，接着又觊觎刃手中的雷神剑，派遣八鬼中的蛙男和蛇男前去夺取。

铁刃为了调查古代剑豪佐佐木小次郎的宿敌——宫本武藏曾持有的妖刀“晾衣杆”而前往岩流岛，途中却遭遇鬼丸国纲手下八鬼之一的蜗牛怪偷袭，体力耗尽。在这样狼狈的状态下，他们顺路来到了汤之峰温泉。被可疑的老板娘以“第一百万名过客”为由热情招待，稀里糊涂地被迎进了温泉旅馆。正当他们享受温泉时，新的黑手正悄然逼近，目标直指雷神剑……？

海参男加入后，铁刃和伙伴们再次朝着岩流岛进发。途中一行人来到名古屋，悠闲地享用着当地特色味噌炸串。然而，一声陌生的低语突然传来——下一秒，纱耶香的炸串竟不翼而飞！自称“蝙蝠男”的神秘人突然现身，目标直指雷神剑。剑士们面对他压倒性的实力，只能勉强招架。武藏立刻赶来支援，却被蝙蝠男一口咬住后颈。紧接着，武藏的身体开始发生诡异的变化……

铁刃一行人终于抵达岩流岛。奉命提前埋伏的蜘蛛男已通过鬼丸的命令复活了佐佐木小次郎。但由于仓促复活，小次郎一时无法理解现状。起初他似乎也没认出年迈的武藏，不过在武藏的挑衅下战斗随即展开。然而面对从黄泉之国归来、保持着四百年前全盛姿态的小次郎，武藏逐渐被逼入绝境，就连赶来支援的铁刃也陷入危机。

佐佐木小次郎的必杀剑“燕返”险些将铁刃置于死地，但铁刃被蜘蛛男开启的时空裂缝吸入，回过神来竟穿越到了400年前的世界！​​为了回到原本的时空，他必须确保宫本武藏按照历史记载，在岩流岛之战中击败小次郎。然而，由于刃多嘴的一句话，武藏的战术布局彻底崩坏，历史即将被改写……！？

经过武藏的修行，铁刃终于能够驾驭雷神剑而不至于暴走。然而，以当前的状态，仅仅是操控剑的力量就会消耗大量气力与体力。为此，从严流岛回到峰家的铁刃一行人，与不知为何留在家中的小次郎和武藏一同，为创出能对抗鬼丸的新必杀剑，再度投身修行之中。​

历经苦修终于掌握必杀技“雷光斩”的铁刃，率众杀向鬼丸城。他斩杀守卫城堡的黑鬼兵所向披靡，却在直面鬼丸之际遭蛛男暗算，众人各自跌入城底深渊。在那片宛如异界的奇幻之地等待着他们的，正是鬼丸麾下的新战力——鬼丸四天王。

击败鬼丸四天王的铁刃正一脸轻松，却不料鬼丸早已在其身后严阵以待。鬼丸冷静地邀他共谋征服日本，铁刃却坚称自己乃正义使者。这对宿敌自力量觉醒前便屡屡争锋，彼此相斥的命运始终难改。从小夜手中接过雷神宝玉的铁刃，终于解放出雷神剑的真正力量——古往今来雷神剑与风神剑的宿命对决，此刻轰然展开——

决战的结局是两败俱伤——铁刃失去了雷神宝玉，鬼丸折断了风神剑。鬼丸军团就此销声匿迹，日本迎来了短暂的和平。在这段平静的日子里，邻里间流传着有位女性“踢馆者”的传闻。正当刃如常与武藏进行修行时，被小夜拜托外出采买。而就在铁刃离开道场期间，那位传闻中的踢馆者竟来到了峰道场。她自称是铁刃的未婚妻……！？

雷神宝玉被鬼丸夺走后，铁刃得知存在能让人飞行的“龙神宝玉”，为获取宝玉决定再次启程。根据抚子持有的古地图，虽然标注了数处宝玉位置，但无法确定哪处是龙神宝玉。铁刃一行人首先前往地图标示的琵琶湖。与此同时，鬼丸察觉到铁刃在寻找龙神宝玉，利用古代剑豪的灵魂制造新型刺客，将其派遣至铁刃所在之处。

在琵琶湖的并非龙神之玉，而是“水之玉”。看来除龙神之玉外，世间还存有其他传说之玉。为追寻下一颗宝玉的下落，众人启程奔赴四国。在剑山深处，相传封印着金长狸所禁锢的传说之玉。悄然逼近寻玉的刀使们的，是忍者・风魔小太郎。与此同时，鬼丸正逐步推进“鬼丸天下统一计划”，意图将整个日本收入囊中。

这一次，在四国地区，刃一行人获得了能够实现变身的“金色宝珠”。他们朝着下一颗宝珠的所在地・九州出发，随即运用金色宝珠的力量变身成木筏，载着全员渡海前行。抵达九州的刃一行人，与曾经的敌人海星人再次相遇。据他所说，传说中的宝珠似乎沉睡在阿苏山火山口的最深处。在海星人的引导下，刃他们立刻动身前往——而在他们身后，蜘蛛人与天草四郎正悄然尾随而至。

在九州获得“火球”的刃一行，来到了奈良。正当他们等待抚子的情报时，一位自称石田六右卫门的男子前来恳求加入队伍。此人似乎正在游历修行途中，听闻了刃一行的事迹。当夜，沙耶香收到抚子联络，称已查明宝玉下落。正当沙耶香要告知众人时，武藏却不知为何阻止她透露地点。

在大阪与石川五右卫门交战的刃一行，虽获得了能令人巨大化的“大玉”，却被夺走了“水玉”与“金玉”。为夺回宝珠，正前往飞驒高山筹备川中岛决战的刃等人，途中邂逅了武藏曾经的弟子——柳生十兵卫三严。然而，十兵卫在遇见刃一行前的经历，似乎记忆模糊不清……？

随着十兵卫加入队伍，实力增强的刃一行人，为夺回被抢走的宝玉，再度与五右卫门展开决战。抵达川中岛的刃等人虽遭埋伏的五右卫门奇袭攻击，仍与同伴组成阵型应战，却被五右卫门派出的黑鬼忍者军团包围。最终凭借武藏、十兵卫与抚子的奋战，他们成功杀出一条通往敌将的血路。刃与五右卫门的单挑对决，就此拉开序幕。

五右卫门所获宝玉的真身，竟是会吞噬怀梦之人的“暗之玉”。被吸入玉中的刃与十兵卫，遇见了暗世界的向导克洛吉。在这个世界中，任何梦想都能实现，但似乎无法离开此地。然而，从克洛吉口中打听到暗之瀑布后方存在出口后，刃与十兵卫立刻赶往瀑布，却见一只名为克洛介的河童似乎在守护着出口……？​

成功集齐六颗传说宝玉、正在寻找最后一颗宝玉的刃一行人，造访了最后的所在地——青森。抵达某座寺庙时，他们手中的宝玉仿佛与最后一颗产生共鸣般突然发光。在众人惊讶之际，一位自称松尾芭蕉的老人现身，手中正握着他们苦苦寻找的最后一颗宝玉。围绕宝玉的争夺战就此展开，但芭蕉显露真实身份后使出的石化攻击让他们陷入了苦战。

在最后一块传说之玉“本体玉”的指引下，为了获取据说藏于富士山口的龙神玉，剑士们踏上了前往富士山的征程。据本体玉所示，当集齐七块宝玉之时，便能得到龙神玉。彼时的富士山上，鬼丸已习得全新必杀剑“龙卷斩”，正严阵以待，准备迎击前来的剑士们。一场围绕龙神玉的战斗，即将拉开帷幕 ——

到达富士山火口的刃，为获得龙神之玉，使用作为钥匙的七颗玉挑战龙神试炼。紧接着，刃在入口的陷阱中失去了庄之介。面对声称战斗必然伴随牺牲的龙神，刃心中涌起愤怒。在武藏的劝诫下，他下定决心，咽下失去同伴的悲痛，继续迈向下一场试炼。然而，龙神的试炼才刚刚开始。

历经重重考验终于抵达最终试炼的刃，在那里等待着他的是本以为早已失去的同伴们，以及史上最强的宝玉“龙神玉”。来自龙神的最后试炼，是做出抉择。即“拯救同伴，失去龙神玉”抑或“抛弃同伴，获得龙神玉”——必须从二者择其一。同伴的性命，还是龙神玉？刃最终作出的选择究竟是？

历经试炼成功获得龙神宝玉与魔剑龙神剑的刃，在获得飞天能力后与鬼丸在太平洋上空展开激战。正当决战白热化之际，空中突然显现巨型飞船。在刃与鬼丸惊愕之际，一位自称从千年沉睡中苏醒的月之支配者·辉夜赫然现身。一场围绕刃、鬼丸与辉夜的三角混战骤然爆发。