第 1 季

废柴新手老师安倍晴明前往充满妖怪的百鬼学园任教。为了拍摄二年三班全体的班级照，他前去拜访家里蹲的座敷童子「红子」，然而……！？

今天是学生们的体检日！要让一目小僧「连助」进行视力检查，还有让大太法师「大田」接受身高测量等，这让初来乍到的晴明在百鬼学园的洗礼中吃足苦头。然而，不幸的事还不只如此，更多的麻烦正接踵而至……！

晴明观摩由酒吞童子「神酒」老师所上的课。当神酒老师酒后乱性时，晴明被迫使用了退魔之力，然而……？与此同时，泥田等人为了夺回被没收的游戏机，准备趁晚上潜入职员室……

妖怪电视台突袭采访晴明！？在课外教学的混乱中，妖怪学生们团结一心，试图让晴明风光亮相。这场取材究竟能否顺利播出呢……！？

晴明于黄金周返乡探亲，但他的双胞胎哥哥「雨明」却劝他辞去教师的工作，这令他感到震惊不已！跟随晴明返乡的佐野等人也大感意外，晴明那不为人知的过去也逐渐被揭开了……！？

运动会开幕！借物接力、曼陀罗草投篮等妖怪独有的竞赛项目，让场面热闹非凡！以二年三班的胜利为目标，赌上晴明的「×××」，一场热血沸腾的战斗就此展开！

运动会进入白热化阶段！在六个班级中奋战争取第三名的二年三班，下定决心要在最后一项障碍接力赛中夺得第一！然而，意外突然发生，让运动会的进行朝向意想不到的方向发展……？

晴明的兄长雨明竟然代替他成为教师！？柳田的迷恋药让学园陷入一片混乱！？三班全员的沐浴场面惊爆登场！？在热闹非凡的百鬼学园里，今天又有一场爱情风暴席卷而来……！

动物妖怪接连遭到绑架，其毛发也被强行剃去！连豆吉和玉绪也神秘失踪，晴明与佐野等人立刻展开营救行动。犯人的真正目的究竟是什么？而犯人又到底是谁呢？

名为林间学校，实则是妖怪学的期末考！学生们将在旧校舍这个舞台上，面对各式各样的考验。他们究竟能否顺利通过考试，迎来最后的胜利呢！？

晴明首次进行家庭访问，但事情并不如预期般那么简单！访问结束后，晴明与神酒、秦中一同前往京都进行修学旅行的事前探勘，然而……

二年三班的学生们远赴东京进行校外教学。然而，晴明却在抵达后突然走失了！全班学生齐心协力搜寻整个东京，然而佐野似乎有种不祥的预感……

暑假终于来临！在学生们尽情享受夏日的同时，晴明造访了佐野打工的古书店。他拿起了一本名为「趣味机关」的书籍，谁料竟由此掀起了一场意想不到的风波！？

暑假过半，红子的老家是一间民宿，那里即将迎来一家灵异杂志的采访。面对不相信妖怪存在的科学家，民宿将展开一场怪异现象的全力演出！

暑假还在继续！晴明应邀前往神酒的老家，并意外揭开了神酒凛太郎埋藏已久的黑暗过去……这时，超级凶恶“敌人”突然现身，危机一触即发！？

神酒带着秦中的孩子们拜访晴明的老家！接着，会盗窃「珍贵之物」的恶棍妖怪——咔哒咔哒也出现了......在百鬼学园岛上，一场追捕剧正式开幕！

暑假进入尾声！二年三班的学生们在海边尽情玩乐。与此同时，正在为妖怪的诞生历史做研究的佐野，却意外揭露了某位学生隐藏的身世秘密！？

来自神明学校的福之神「惠比寿夷三郎」以临时教师的身份加入百鬼学园，并担任二年三班的副班导！与此同时，晴明却不知为何待在办公室里闭门不出……？

文化祭前夕，晴明与学生们外出采购用品！他们搭上电车时意外遇见了高桥老师与歌川小姐……说起来，这辆电车是不是有些不对劲……？

百鬼学园内的文化祭准备得如火如荼，二年三班的学生们也忙得不可开交！然后，期待已久的夜行文化祭终于开幕了！二年三班准备的节目究竟是……！？

文化祭第二天！为了准备文化祭的用品，玉绪与晴明来到学园的地底下。这里气氛诡异，处处透着不寻常。这时，一个可疑的人物突然现身……？

连助竟然决定要退学！？二年三班陷入震惊与不解，并试图挽留他。连助之所以决定要退学，似乎与他的父亲有关！？连助隐藏的过去究竟为何！？动画《妖怪学校的菜鸟老师！》最终章，即将开幕！

为了营救连助，大作战正式启动！面对接连来袭的眼球妖怪，二年三班陷入苦战。晴明不惜赌上自己的教师生涯展开营救行动！这场事关连助命运的行动，究竟能否成功！？

为了营救连助，晴明与二年三班的所有人进攻入道家。在众人携手合作下，玉绪率先奔向连助！这时，连助做出的选择究竟是……！？