第 1 季

绝地大师尤达和三名克隆人士兵与杜库伯爵可怕的刺客文崔斯和她的机器人军队展开对决，以证明绝地有足够的力量保护一颗具有战略意义的星球，并为共和国缔结条约。

分离势力用一种新型毁灭性武器攻击了绝地大师普洛·孔和他的克隆人部队，导致他们在找到阿纳金和阿索卡前只能挣扎求生。

在学徒阿索卡和绝地大师普洛·孔的帮助下，安纳金利用新型远程Y翼轰炸机对格里弗斯将军的战舰“毒牙号”及其毁灭性武器进行了大胆的打击。

帕德梅和C—3PO在一场太空大战中被抓。

身处遥远的前哨站，克隆人军官雷克斯和科迪必须激励他们的部队新成员相信自己，以对抗机器人突击队的入侵。

R2-D2在一场激烈的太空战斗中失踪了，安纳金必须在分离势力发现锁在他记忆库里的绝地军事秘密之前找到他。

发现R2-D2被关押在格里弗斯将军的一个秘密敌方情报站后，安纳金、阿索卡和替代机器人R3开始了营救和破坏的双重任务。

加·加·宾克斯是绝地武士？当英勇的冈根人和C-3PO从邪恶总督纽特·冈雷手中救出帕德梅·阿米达拉时，分离势力就是这么认为的。

阿索卡和绝地大师卢米娜拉护送被俘的总督纽特·冈雷接受审判，却不知道杜库伯爵已经派遣了他的致命学徒、刺客阿萨吉·文崔斯去释放囚犯并消灭绝地。

当杜库伯爵将绝地大师基特·费斯托和他以前的徒弟、蒙卡拉马里绝地武士纳达·韦布引诱到格里弗斯的邪恶领地时，格里弗斯将军必须证明自己无愧于分离势力。

在试图绑架杜库伯爵的过程中，安纳金和欧比旺发现这位西斯尊主已经被海盗俘虏了。

在谈判杜库伯爵的赎金时，安纳金和欧比旺被俘虏了。为了逃跑，绝地和西斯组成了不可思议的联盟，而加・加・宾克斯是他们唯一的希望。

安纳金在战斗中身负重伤，绝地将军艾拉・塞库拉必须教导阿索卡绝地的不谈私情理念。与此同时，他们还要在一颗充满敌意的星球上勇敢地为这位绝地武士寻求医疗帮助。

当绝地与分离势力的一种新武器作战时，和平主义者勒明人必须决定是屈服于分离势力的压迫，还是与安纳金、阿索卡 和绝地将军艾拉・塞库拉一起作战。

在调查克隆人安全部队的失踪时，阿纳金和欧比旺被卷入了一场冲突，冲突的一方是荒凉冰雪世界的长毛居民，另一方是附近一颗卫星的贪婪代表。

安纳金和欧比旺在试图带领共和国军队从分离势力的包围中解放克里斯托夫西斯星球时，发现了他们队伍中有一个叛徒的证据。

帕德梅和加・加在找一个秘密的分离势力生物武器实验室时被捕，安纳金、欧比旺和阿索卡试图拯救他们的朋友，并阻止一种致命病毒的释放。

致命的蓝影病毒被释放后，感染了阿索卡、帕德梅和许多克隆人士兵。安纳金和欧比旺必须赶紧前往一个从未有访客返回的神秘星球寻找解药。

阿索卡不服从安纳金的命令，失去了她大部分的中队——这促使阿纳金给他的徒弟上了一堂尊重权威的课，并给了她救赎的机会。

为了破坏分离势力的一种强大武器，欧比旺和一支小型克隆人部队进入了一个被占领的城镇，发现那里的居民被用作人肉盾牌。

由于兵力不够，梅斯·温杜必须说服提列克自由战士查姆辛杜拉帮助他从机器人的毁灭行动中拯救首都。

为了解救犯罪头目赫特人齐罗，赏金猎人占领了参议院大楼并劫持了人质，但他们完全不知道绝地武士安纳金天行者还在大楼里面。