第 2 季

达斯·西迪厄斯雇佣了一个赏金猎人去绝地圣殿档案库进行盗窃。

在被阿纳金和阿索卡的追捕的同时，凯德·贝恩想尽方法要开启他替达斯·西迪厄斯偷来的全息记录仪。

根据从失窃全息仪里获得的信息，达斯·西迪厄斯命令凯德·贝恩绑架一些原力敏感儿童为自己的阴谋服务。

绝地委员会怀疑来自银行业代表团的拉什·克洛维斯议员替贸易联盟工作。他们要求他从前的恋人阿米达拉议员与其重聚并探查此事。当她陪同克洛维斯前往凯托内莫伊迪亚时，阿纳金·天行者假扮成纳布飞行员与他们同行。

绝地将军基-阿迪-芒迪、欧比旺·克诺比和阿纳金·天行者重返吉奥诺西斯——克隆人战争的爆发地点。他们的任务是摧毁下等人波格尔的一座受到射线护盾保护的机器人工厂，这或许能够给人数居于劣势的克隆人部队带来一线生机。

下等人波格尔打算出动他的新型坦克。阿纳金·天行者和卢米娜拉·昂杜里对波格尔的工厂发动正面进攻，同时他们的学徒巴丽斯·奥菲和阿索卡·塔诺从地下迷宫里渗透进去。

卢米娜拉·昂杜里在追击下等人波格尔的途中消失在一阵沙尘暴里。当阿纳金和欧比旺追踪她到一座古庙时，他们遭到了吉奥诺西斯亡灵战士的袭击。

阿索卡和巴丽斯登上一艘补给船前往塞斯特斯兵站星附近的医疗站，但船上有一名士兵之前被吉奥诺西斯的脑虫感染控制，致使身上携带一整巢可以传染给别人的虫卵。

伊思·科思大师追踪到了格里弗斯将军，但很快就被他抓住，并折磨给绝地们看。欧比旺、阿纳金和阿迪·加利亚试图出发营救他，但却不知道格里弗斯已经料到了这一点。

欧比旺和501军团的一支小分队追踪格里弗斯将军到了萨卢卡迈星球。雷克斯上尉受了伤并被送到一座农舍疗养，却发现农舍的主人拥有一张熟悉的面孔。

阿索卡在科洛桑地下世界执行任务时光剑被小偷偷走了，由于不好意思告诉阿纳金，她决定单独一人追查小偷。令她意想不到的是，她从一个叫做泰拉·西努贝的年老大师那里得到了帮助。

由于坚决反战，曼达洛的莎廷女公爵成为了中立星系委员会的领导人物。欧比旺·克诺比在她的星球上调查有关所谓死神卫组织东山再起的传言。

欧比旺和阿纳金护送莎廷女公爵和中立星系委员会乘坐豪华游艇宝冠号前往科洛桑，但他们中有一个叛徒偷偷把一个蜘蛛形的刺杀机器人带了上来。

超凡维兹拉已经将死神卫发展成一支军队，正在等待时机接管曼达洛。在科洛桑，莎廷女公爵试图阻止共和国派军队到曼达洛进行维和，但她不久就发现自己遭到了死神卫杀手和共和国当局的双重追杀。

帕德梅正致力于推动法案减少军费开支并停止制造克隆人，但她最信任的盟友之一遭到了毒杀，她和贝尔·奥加纳开始追查凶手。

阿纳金受命驾驶一艘拥有隐形装置的飞船到克里斯托弗西斯星球运送补给给贝尔·奥加纳议员，但由于封锁星球的是声名狼藉的特伦奇上将，安纳金忍不住要出手进攻。

欧比旺、阿纳金和阿索卡迫降在费卢西亚星球，并不得不加入了由四个赏金猎人组成的队伍，去保卫一座村庄不受杭多·奥纳卡海盗团伙的袭击。

共和国引爆了一枚威力强大的电场质子炸弹以解决马拉斯塔尔行星上的战斗，但它意外地唤醒了一头被认为已经灭绝了的斯洛怪兽。

斯洛怪兽被抓住了，它被送到科洛桑进行测试研究。帕尔帕廷议长想要揭开它刀枪不入的秘密，但却使得这头怪兽足够愤怒以逃脱人们的掌控。

波巴·费特决心杀死梅斯·温杜为父报仇，他混进了一群克隆人学员里，登上了绝地巡洋舰忍耐号。

当阿纳金和梅斯试图从坠毁的巡洋舰中营救基利安上将时，他们走进了波巴·费特和他的赏金猎人同伴设下的陷阱里。一切都取决于R2-D2能否把消息传递出去。

波巴·费特和奥拉·辛试图用人质逼梅斯·温杜来见他们。由于梅斯和阿纳金仍在康复中，普洛·孔和阿索卡·塔诺出发追踪赏金猎人。