特别篇特典 / 番外 · 2 集 · 2002/12/21火影忍者OVA是火影忍者动画本集之外的动画剧集。

第1季第 1 季 · 52 集 · 2002/10/3第 1 季包含《波之国篇》和《中忍考试篇》《波之国篇》（日语：波の国編）火影忍者动画开篇，在2002年10月3日－2003年4月2日期间播出，改编自原作漫画的第1－44章。主要讲述成为下忍的漩涡鸣人、宇智波佐助和春野樱组成由旗木卡卡西带领的第七班，受令执行他们的首个“C级任务”，保护一名来自波之国造桥师的安全及免受“雾隐鬼人”侵袭。《中忍考试篇》（日语：中忍試験編）火影忍者第二篇章，在2003年4月2日－2003年10月1日期间播出，改编自原作漫画的第45－89章。主要讲述波之国任务结束不久，木叶村迎来一年两度的“中忍选拔考试”，第七班与其他同期下忍都获得推荐参加，使他们必须想办法应对危机四伏的考试难题、以及来自其他村子的“强敌”。

第2季第 2 季 · 52 集第 2 季包含《毁灭木叶行动篇》和《纲手搜索篇》《毁灭木叶行动篇》（日语：木ノ葉崩し編）火影忍者第三篇章，在2003年10月8日－2004年4月21日期间播出，改编自原作漫画的第90－138章。故事直接延续中忍考试预选过后，所有晋级者各自修炼后参加正式选拔赛。但比赛过程中，敌人突如其来展开的“毁灭木叶行动”迫使考试中断，导致各个下忍、上忍以及三代火影，为了保护木叶村而与敌人展开背水一战。《纲手搜索篇》（日语：綱手搜索編）作为火影忍者第四篇章，在2004年4月28日－10月27日期间播出，改编自原作漫画的第139－171章。主要讲述经过毁灭木叶行动过后，为了使群龙无首的木叶村重回全盛时期，鸣人跟随之前陪他修炼的师父自来也，一起去寻找离村多年的初代火影孙女纲手，打算让她接任火影之位。但另一边，毁灭木叶的罪魁祸首大蛇丸，同样把魔掌也伸向纲手。后半段为动画首个原创剧情篇章，在2004年9月15日－10月27日期间播出。主要讲述纲手接任五代火影之后，鸣人、小樱以及康复的佐助，负责保护茶之国少年森乃伊驮天而让他赢下一场赛跑，避免外面的敌人前来干预伊驮天的比赛。

第3季第 3 季 · 54 集第 3 季包含《佐助夺还篇》《佐助夺还篇》（日语：サスケ奪還編）火影忍者第五篇章，在2004年11月3日－2005年5月18日期间播出，改编自原作漫画的第172－238章。主要讲述佐助因接连失败而陷入比以往更强烈的复仇怒火，已不近人情的他主动接受大蛇丸派来的音忍四人众邀约，以投奔敌人的方式寻求力量。他的逃跑迫使鸣人与同期三名下忍，在当上中忍的鹿丸带领下进行这项危险的艰巨任务，从敌人手中将佐助救回木叶。

第4季第 4 季 · 62 集第 4 季《原创篇》《原创篇》（日语：オリジナル編）自2005年5月25日开始到2007年2月8日期间，《火影忍者》播出共84集的动画原创篇章，故事设定于佐助夺还行动过后以及动画疾风传之间，主要讲述鸣人一行伙伴各自的任务故事，期间一小部分内容则改编自原作漫画的第236－238章。