第 2 季

在南岛之战中战胜鹰冈的E班学生们，迎来了杀老师为撮合情侣而策划的“试胆大会”。然而，活动不知不觉竟演变成了E班全员助攻伊莉娜与乌间老师的作战，其结局究竟如何？暑假已近尾声，学生们满怀期待地迎接第二学期的到来，而在这背后，一个神秘男子的身影也悄然浮现……

由茅野发起的暗杀方案——“布丁爆杀计划”正式启动。E班学生们在平时总担任后援的茅野指挥下，尝试对杀老师展开暗杀。乌间老师的训练日益严苛，还在后山开展了运用跑酷的“暗杀抓小偷”课程。E班的实力稳步提升，但另一方面，轰动椚丘市的“内衣大盗”新闻也令人十分担忧……

在白先生的率领下，堀部丝成再次向杀老师发起了袭击。双方展开了激烈的交锋，面对将堀部丝成视为弃子的白先生的毒计，E班学生们四处奔走，试图将堀部丝成从他的“执念”中解救出来。面对教导自己如何立足的寺坂等人，内心充满纠葛的堀部丝成将会做出怎样的选择……？

正式加入E班的堀部丝成发挥自身特长，促成了一场“遥控车作战”，让心怀鬼胎的男生们空前团结，瞒着女生们制定了周密的计划。某天，为了在意自己本名的木村，杀老师提议在这一天里，全班学生都只能用代号互称，引发了一连串意想不到的笑料……

E班的帅哥班长矶贝悠马，为了补贴家用而违反校规打工，却被A班的五英杰意外撞见。浅野学秀开出了放过他的条件：E班必须在即将到来的体育祭上战胜A班。两位拥有截然不同领袖资质的人展开正面交锋，这场对决的结果究竟如何……？

距离期中考试还有两周的某天，过于自信暗杀技术的E班学生们，意外导致某保育设施的年迈园长身受重伤。为了纠正学生们错误的力量使用方式，杀老师禁止了所有的备考学习，并要求他们在该设施做志愿服务。面对老旧的设施和调皮却各有问题的儿童，E班的学生们将作何应对……？

乌间老师对伊莉娜老师的生日毫不在意，E班的学生们心生一计，试图设局让他送上花束。然而计划轻易败露，从那天起伊莉娜老师便再未在学校露面。就在大家愈发担忧之时，一位自称“死神”的杀手突然现身，宣告已绑架伊莉娜，并要求学生们只身赴会。E班的学生们前去营救，等待着他们的将会是什么……？

面对深不可测的“死神”，E班的学生们毫无还手之力。杀老师和乌间老师赶到现场，全员与“死神”展开对峙，然而倒向“死神”阵营的伊莉娜老师却阻挡在他们面前，连杀老师也沦为阶下囚。为了破局，乌间老师只身追击，他与“死神”的终极单挑就此拉开帷幕……

步入成熟的11月，距离暗杀期限仅剩4个月，进路咨询的时期也随之到来。在同学们各自思考未来去向并做出决断时，渚却陷入了深深的苦恼。就在这个时候，渚的母亲突然出现，并以强硬的态度宣告“要让他退出E班”……

考验班级经营手腕的椚丘学园祭正式开幕，浅野学秀率领的A班举办了带有企业赞助的华丽活动。另一边，E班则反向利用旧校舍偏僻的地理位置实现自给自足，以使用天然食材的深山食堂一决胜负。期间，更有历代暗杀者以及冲着“小渚”而来的裕二君相继现身，场面彻底失控……

在学园祭上大放异彩的E班引来了全校关注。将其视为违背教育方针的浅野学峰理事长，与将E班视作优秀对手的儿子浅野学秀，父子间的对立日渐加深。下一个决战舞台便是期末考试。学秀堂堂正正地向E班发起了挑战。当期末考试如期而至，面对接连出现的超高难度试题，学生们将如何应对……？

E班与A班的期末考试对决终于迎来最高潮。尤其在难题频出的数学科目上，当其他学生纷纷中途败退时，最后的压轴题演变成了赤羽业与浅野学秀的巅峰对决。在各自与终极难题苦战之际，业回想起了在E班度过的点点滴滴，突然领悟到了某个关键。年级第一的宝座究竟会花落谁家……？

期末考试落幕后，浅野学峰理事长竟以解雇为筹码，单方面向杀老师发起了赌局。被指极为相似的两位教育者，其对决的真意究竟为何？彻底改变浅野理事长的往日事件即将揭晓。另一方面，E班决定在戏剧发表会上演出《桃太郎》，且主角竟由杀老师担纲！这场荒诞的戏剧究竟会走向何方……？

戏剧发表会结束后，杀老师也跑来帮忙渚和枫整理仓库。众人兴致勃勃地回忆起过往的暗杀计划：杀老师初次现身教室的惊愕、赤羽业休学归来的狂妄、堀部丝成突入战场的震撼，以及由茅野枫主导的“布丁爆杀计划”。然而就在谈笑风生之际，枫的神态却悄然发生了异变……

面对性情大变的枫的猛烈攻击，杀老师不惜以自身的弱点为诱饵，将阻止她暴走的希望全权托付给了学生们。在这千钧一发之际，渚究竟采取了怎样出人意料的行动？当全班同学再次齐聚一堂时，杀老师终于缓缓揭开了自己过去的封印。学生们也终将知晓“杀老师究竟是何方神圣”……

“于是超生物娓娓道来，讲述那段被尘封的人类记忆。”曾经代号为“死神”的顶尖杀手，沦为了柳泽制造反物质的人体实验对象，却在冰冷的实验室中与雪村亚久里产生了跨越心灵的羁绊。然而，实验体死神体内的能量即将突破极限，不仅自身会毁灭，更将在明年引发拉上整个地球陪葬的大爆炸。得知真相的柳泽，冷酷地下达了抹杀指令……

“我们真的非杀掉这位老师不可吗？”得知杀老师凄绝过去的学生们，猛然面临着前所未有的残酷难题。正因为彼此间结下了深深的羁绊，为了守护内心的那份珍视，持完全相反意见的渚与业爆发了激烈冲突，甚至令整个班级陷入了分裂的危机！面对僵持不下的众人，杀老师给出了一个极具“暗杀教室特色”的破局之法……

正因为每个人都对杀老师抱有最真挚的情感，这场因理念分歧而引发的暗杀生存战，最终演变成了“拯救派”的代表·渚与“暗杀派”的代表·业之间的终极对决。这对明明是朋友、彼此间却总隔着一层客套的挚友，终于毫无保留地展开了性命相搏。这场拼尽全力的厮杀，究竟会迎来怎样的结局……？

E班截获了一份机密情报——能够拯救杀老师的研究，正悄然在浩瀚的宇宙空间中进行。为了盗取关键的实验数据，渚与业作为班级代表，神不知鬼不觉地潜入了即将发射的无人火箭之中。怀揣着对恩师的拯救之心，一场极不合常理的“太空自由研究”就此轰轰烈烈地展开……

考试季终于来临。在杀老师极其热烈（且丢人）的应援下，渚硬着头皮迈向了考场。随之而来的便是充满心跳的情人节。看着迟迟不敢将巧克力递给渚的枫，唯恐天下不乱的业和中村怎会袖手旁观？不仅其他同学们各自迎来了酸甜苦辣的情人节，就连一直原地踏步的乌间与伊莉娜之间，似乎也终于有了意想不到的新进展……！

全员的毕业去向均已尘埃落定，杀老师正倾注心血地制作着E班的毕业纪念册。然而，政府的最终暗杀计划终究还是启动了。杀老师被媒体报道为企图毁灭地球的危险生物，E班全员也被置于严密的监视之下。“好想见杀老师！”——怀揣着这份心意，学生们下定决心采取了行动……

距离杀老师的暗杀期限仅剩3小时，天基激光武器的照射时间也在分秒逼近。学生们突破了政府的重重警备，终于在旧校舍与杀老师重逢。在亚久里为他定下生日的一年后的这个夜晚，师生们享受着片刻的欢谈。然而，柳泽与面目全非的二代死神却在此时赫然现身……

杀老师VS二代死神。获得了凌驾于杀老师之上能力的二代死神，加上将自身也进行改造的柳泽的助阵，最终决战全面爆发。面对一边保护学生一边战斗的杀老师，被憎恨吞噬的二人发动了毫不留情的猛攻。就在这十万火急的绝境之中，一个意想不到的人物发动了攻击……

承载着这一整年珍贵回忆的旧校舍里，只剩下了杀老师、乌间、伊莉娜，以及三年E班的学生们。暗杀期限步步紧逼，所剩的时间已寥寥无几。面对E班学生们最终交出的答卷，满身疮痍的杀老师露出了欣慰的笑容，轻轻地点了点头……

“再见了，杀老师。再见了，椚丘中学。”与杀老师共度的这一年，将会是无比珍贵的回忆。E班的学生们正式从“暗杀教室”毕业启程，向着未来迈出了坚实的下一步。随后，岁月流转……