第 1 季

因事故失去父母、被叔父夫妇收养的稻叶夕士。正想着高中住宿舍自立…谁知宿舍因火灾烧毁了。好不容易找到的公寓，是月租两万五千日元的破格物件。那里是妖怪、幽灵与人类共同居住的“妖怪公寓”！

个性丰富的妖怪们。以及被超过他们的怪癖人类住客们包围，夕士的高中生活开始了。某天，夕士遭遇了同学·田代的事故现场。是被公寓感化了吗，事态向着意想不到的方向发展……。

小孩幽灵·阿栗与狗的幽灵·小白总在一起。但原因似乎与阿栗死去的原因有关……。夕士与出现在妖怪公寓的阿栗的母亲对峙，思念起自己已经不在了的、母亲对孩子的爱。

宿舍重建，夕士离开公寓的日子迫近。公寓成员们热闹而温暖的送别会。夕士还收到了饱含心意的饯别礼。再见了妖怪公寓。于是夕士的“这一边”的生活开始了。

搬进宿舍的夕士再次对普通生活感到困惑，也因宿舍的人际关系而别扭烦恼。此时，他在街上与作为上班族在人类社会工作的幽灵·佐藤先生重逢。并与存有隔阂的表姐妹·惠理子也重逢了……。

在世界各地寻找珍本·奇书的“旧书店”久违地回到了寿庄！那个飘然男子带回来的书中，有一本名字读不出的塔罗牌画集…。夜里，夕士在梦中被那本书的精灵称为主人。那竟然是名为“Petit Hierozoicon”的魔道书！

成为了魔道书之主的夕士，却因偶然被好友长谷发现了此事！不得不坦白自己住在妖怪公寓了…。与此同时，还开始了为了魔道士修行的灵力特训！

长谷终于来公寓了！他给寿庄的人们带了用心的礼物，但他能否接受住在这里的妖怪·幽灵·精灵等不可思议的存在呢？夕士忐忑不安。而长谷却被小孩幽灵小栗的可爱彻底迷住了——？

暑假结束新学期。担心跟着来学校的福尔被他人看见，夕士忐忑不安地上学。他从别的学校调来的教师·三浦身上感受到一种“昏暗”的感觉，莫名在意。此时，从与世界相位不同的隐里，一位被称为又十郎的巨人来到了！

与田代他们说话时被新教师三浦怒吼的夕士。虽无法接受，但他对当时谈论的学校怪谈很在意，开始调查。召唤诺伦三姐妹占卜怪谈，感觉似乎有什么粘稠之物。然后夕士与田代在戏剧部杂物间发现了“诅咒女人的话语”的涂鸦……。

偏离常轨的三浦究竟发生了什么？夕士再次从Petit Hierozoicon召唤科克玛进行调查。一边与寿庄的大家商量一边逼近真相。小房间涂鸦的意念。积攒的负面情感化为“本我怪物”寻找着容器…！

被“本我怪物”附身的三浦袭击田代…！如果说三浦是因为过去的痛苦经历而成为本我怪物的容器是命运的话，那么与三浦的相遇也是命运。如此认为的夕士为了拯救三浦开始行动！

夏日积雨云之下，夕士开始了为提升力量的魔道士修行。相当艰苦，身体动弹不得，最后被深濑公主抱抬走。各种意义上的艰苦修行…！夕士暴瘦，美味食物也难以下咽，对是否真的在成长感到不安。寿庄的大家向他讲述了“迷惘”的重要性。

暑假后半，长谷又来寿庄玩了。仿佛要治愈疲惫的身体一般，长谷疼爱着小栗，和大家一如既往地开宴会，度过快乐时光。另一方面，修行也一如既往…正想着，嘟囔着“不够”的秋音向房东拜托了什么事…？热热闹闹的寿庄夜更深了。

第二学期开始，新的邂逅来了！赴任条东商的帅气新教师·千晶直己，与清纯女教师·青木春香。性格相反却都深受学生欢迎的千晶和青木。此时，夕士所属的英语俱乐部来了一位麻烦的新成员·山本小夏…？

爱慕中秋明月之秋来了！要尽情享受秋刀鱼、蘑菇、梨、栗子等味觉之秋！最重要的是团子！于是寿庄开始捣年糕准备赏月。此时，秋音的师父·藤之老师，以及打工医院的病人们也来赏月。在妖怪与人类混杂的赏月会上，夕士思考着活着的意义…。

青木老师说夕士失去了父母，应该“很辛苦”。虽是出于善意的温柔话语，但夕士并不这么认为，他对仅凭一面之词妄下定论、强加于人的“善意”感到焦躁。严厉对待、或是什么都不做，有时不也是一种温柔吗？一色先生的话似乎就是关键词……。

埋头于学业与修行的日子，迎来了三连休。但对夕士来说正是赚钱的时候！努力打工的夕士被拜托担任两个新人的指导。但面对视线不对、不知是否在听讲的两个新人，夕士感到不安。就在此时，客户投诉，新人的失误暴露了！

夕士救下了试图从屋顶跳下的少女·浅田有实。她妆容精致、打扮时髦显得成熟，但竟然还是小学六年级！不知为何被她亲近的夕士，带她一起参加英语俱乐部的活动。但意外的是，有实似乎在那里窥见了广阔世界的一角…？

文化祭临近，夕士等人思考班级的展出项目。大家对千晶老师完全放手不管的态度感到惊讶，但夕士从中看到了他对自己的信任，决心回应这份信任。此时，夕士注意到小夏持续缺席英语俱乐部。他渐渐开始看到她披上“镀金”的理由…

古董店进购的诡异油灯。据说能映出百年难得一见的影像。那竟然是可以身在公寓中，就能驰骋于天空、目睹耸立于沙漠的异形之城的神奇油灯！夕士感到世界广阔，但还有更惊人的体验在等着他…!?

千晶大发雷霆！？似乎是用手机发现了作弊的学生，同学们对他与平时不同的态度感到惊讶。事态演变为决定是否彻底禁止携带手机的学生总会。青木不负责任的温柔助长了一部分学生的气焰。态度严厉的千晶。学生总会将如何发展！？

文化祭前夕，条东商高因准备而热闹非凡。表面平静，但学生大会上扮演坏人的千晶遭到的反对声越来越大。对此感到不甘心的夕士和田代等人。学生会长神谷也同样想报答千晶，于是想出一计。另一方面，小夏依然无法融入班级，越发孤立。

英语俱乐部的话剧准备顺利进行，大家正热心练习时，小夏拿着退部申请书来了。她轻蔑俱乐部的活动是幼儿园游戏，加以嘲笑，最后情绪爆发歇斯底里。向这样的小夏伸出援手的，是凡事都认可、肯定、温柔相待的青木…

终于到了文化祭当天！妖怪公寓的成员们也来玩，热闹非凡。深濑闯入美术部，秋音参加大胃王比赛，古董店开着奇怪的义卖…夕士担心着“没问题吗”。而学生会长究竟有何企图？充满波澜的文化祭拉开帷幕！

除夕临近，妖怪公寓开始准备跨年。装饰门松、捣年糕、围坐火锅做准备的夕士。房东甚至将地下空间与大雪原连接起来，那里排列着无数的雪洞！那是“时间雪洞”。只在除夕夜出现、能看到过去和未来的不可思议的雪洞。