第 1 季

主人公·柊京一郎为了在最高学府帝国大学求学，离开故乡桃木村来到了帝都。然而，当京一郎踏上帝都的喧嚣街头时，映入眼帘的却是自己不知为何变得娇小可爱的身影……

京一郎大口吃着帝都名声在外的煎饼，沉浸在幸福之中。但这时，死灵的吼叫声传入耳中。赶到现场后，五本刀头领时雨与特殊游军部队的馆林开等人正在交锋……

隶属于大日本帝国陆军特殊游击部队的伊势馨与薰这对双胞胎兄弟，醒来后也变成了可爱的模样。甚至连队长馆林开也是如此。然而，任务必须完成。加上雄真，四人前往帝都巡逻，并与宿敌时雨相遇。

时雨与馆林等人展开了激战，但在操纵死灵的伊濑兄弟的攻势下逐渐被压制。京一郎想要保护他，此时不知从何处出现的男人——美咲，质问了他的觉悟。京一郎给出的答案是……

京一郎、美咲、时雨三人行进在根之路上。途中出现的五本刀之一——臣告诉了京一郎五本刀究竟是什么。此外，美咲也对他说“不要再牵扯更深了”。另一方面，大日本帝国陆军少将·千家伊织的办公室里，千家已经拿到了京一郎的情报。

在大日本帝国陆军的小会议室里，馆林和千家以可爱的姿态对峙着。千家不忍看到馆林的窘境，告知将由自己亲自接触京一郎。对此毫不知情的京一郎，在黄昏的帝都目睹了军人回收死灵的场面。

京一郎收到了帝国大学寄来的教科书购买指南。他对于即将开始的大学生活充满干劲，但脑海中却浮现出在帝都遇到的美咲、时雨、馆林以及死灵的身影。想着烦恼也无济于事，他便前往商店街，却在归途中遇到了千家。

在结界之中，千家和京一郎相对而立。两人就大日本帝国的现状展开了问答。为了对抗列强，千家所想出的有效手段是――？当得知那个答案时，京一郎被要求向千家宣誓效忠。

京一郎拒绝了千家的邀请。此时，美咲和时雨打破结界冲了进来。京一郎虽然被两人救出困境，但当时雨问他“你想怎么做”时，他却无法回答。自己只是一介学生，又能做什么――？另一方面，千家与馆林也各自怀揣着盘算。

出现在独自沉思的京一郎面前的是馆林。本以为他是来抓捕自己的，但答案是否定的。馆林表示，军部对于是否应该使用死灵兵也存在分歧。然后他也问了京一郎“想要怎么做”。自己该为这个国家做些什么？京一郎的烦恼愈发深重。

火车在深沉的黑暗中行驶。时雨、千家、馆林，各自背负的东西过于沉重，京一郎只能陪伴在他们身旁。美咲守护着这样的他，心中怀有愿望。京一郎下定决心，在遥远的前方看到了光明……

从长梦中醒来的京一郎。火车很快就要抵达帝都。全新的生活即将开始。在文明与电力遍布的帝都，不可能出现死灵。京一郎意气风发地迈出了脚步……