新干线变形机器人Z

小学五年级学生新多进，自称是“解开世界谜题的男人”，喜欢神秘事物。那天也是听闻了外星人的目击情报，来到JR横川站周边调查。途中经过的“碓冰峠铁道文化村”，听到了有谜之新干线被运来的传言，进怀疑这与几年前成为话题的、像幻之机器人“铁道侠”的新干线有关。被新的谜团吸引的进，但……？

正式成为“新干线战士Z E5隼号”驾驶员的阿进，为了进行新干线战士的操纵模拟，再次造访碓冰峠铁道文化村。在那里等待他的是，与阿进同岁却参与着新干线战士改造的天才整备士·碓冰阿伯特。但是，据说阿伯特不知为何不能驾驶新干线战士。当阿进不经意间询问其理由时，阿伯特表情僵硬地离开了现场……。

阿进等人乘坐“E6系小町号”，为了寻找阿伯特在梦中见到的盛冈站的“Z代码”而出发。Z代码被隐藏在日本全国，据说找到它们就能解除新载莱纳的闭塞。为什么Z代码的提示会出现在阿伯特的梦里？为什么要把Z代码隐藏在全国？阿进、阿伯特、斯玛特一边感到不可思议，一边为了寻找新的载莱纳、新的Z合体，在盛冈站周边四处搜寻。

“新干线战士Z E6小町号”的驾驶员·大曲花火，是一位无比热爱摇滚的热情少年。他的老家是制作秋田县大曲名产烟花的烟花工厂。花火一边追寻成为烟花师的梦想，一边说自己也在认真对待喜欢的音乐之路和新干线战士驾驶员之路。但是，花火的父亲·种火，并不认可同时兼顾多件想做的事的花火的生存方式。

阿进等人来到位于长野县木曾的某座山。据阿伯特说，在人迹罕至的这座深山里，有第三位新干线战士驾驶员候补·户隐大树。但是，大树对成为驾驶员并不积极，据说已经拒绝过一次邀请。原本住在东京，但因故移居到木曾某座山的大树。当阿进等人历经登山找到他时，大树正开始在祖父手下见习山里的工作。

为了寻找新的Z代码，阿进等人来到长野站。阿伯特本已放弃，觉得看来无法迎接大树成为驾驶员了。即便如此还是想再和大树谈谈的阿进，拜托阿伯特等人再次去见大树。大树听取了祖父·斧松的建议，为了让阿进理解自己的坚持，决定带阿进去森林铁道纪念馆。

新干线战士的整备士细川喊着“抓到妖怪了！”跑了进来。据细川所说，抓到的是能化身为人的“化狸”，但在阿进等人面前的看起来只是普通的狸猫，没有任何证据能证明它是妖怪。此时，只有阿进一人眼睛发亮地说“要和化狸做朋友！”。那时，在新干线战士手下多次惨败于巨大怪物体的瓦尔德姆，正图谋用自己的力量袭击横川支部。

阿进和E5隼号移师大宫支部的日子临近了。但是，阿伯特不随行，决定留在横川支部。无法接受的阿进和斯玛特追问理由，阿伯特开始讲述自己的家人。另一方面，在大宫支部，E5、E6、E7集结。与花火和大树、横川支部的工作人员一起，曾经历过去战斗的新的伙伴们也齐聚一堂。此时巨大怪物体出现，大宫支部的战斗拉开帷幕。

将突然在九州出现的巨大怪物体击退的，是飞翔于空中的新干线战士，“新干线战士Z 800燕号”。驾驶员是中洲山东。是比阿进等人高一个年级的小学6年生，据说是智力与体力都非常优秀的驾驶员。为了寻找Z代码，阿进等人与山东一同探索太宰府周边。但是，发生了严重的问题。山东竟然说阿进的妖怪话题“不科学”，完全不愿搭理……！？

阿进和山东的个性水火不容，似乎无论如何都无法融洽相处。山东对阿进“非科学”的话题不感兴趣，阿进也对山东敬而远之。对于为如何让山东听自己说话而烦恼的阿进，花火和大树、阿伯特和斯玛特提出了某个作战。那是一个异想天开的作战：让阿进尝试用各种调配食谱，吃他不擅长、吃不下的“御球”……？

阿伯特在梦中看到的名古屋，阿进等人到访。同一时间，在超进化研究所名古屋支部，安城岛风、安城长良这对兄弟正面临决定“新干线战士Z N700S希望号”驾驶员的最终试验。试验结果是两人都合格。但是，哥哥岛风将驾驶员之位让给了弟弟长良，自己拒绝了。长良对岛风似乎逃跑了的做法感到不快。此时，巨大怪物体袭击名古屋港……？

N700S希望号华丽初阵。被岛风所救的长良，为了驾驶员之位，再次向岛风提出空手对决。龙司作为见证人，兄弟之间用拳头进行的交谈开始了。另一方面，阿伯特在梦中看到了Z代码隐藏地点的进一步提示。然而那个提示，指示着一个“既是东京，也是名古屋，又是京都”的不可思议的场所。

阿伯特按照父亲的设计图制造的“新干线战士Z N700S希望号”和“载莱纳 HC85飞弹”的Z合体测试失败了。再这样下去无法追上父亲而焦急的阿伯特，被岛带去参观父亲曾经的工作场所。那里是，承担铁路技术革新、作为先导的“铁道综合技术研究所”。此时，关原出现巨大怪物体。等待新干线战士Z的，是苍玉设下的无数敌人。

阿进听闻铁道博物馆出现“谜之巨人”的传言，与花火、大树、阿鲇一同尝试潜入调查。于是，他们真的发现了类似巨人的身影。为了和那个巨人成为朋友，阿进带着阿鲇等人在铁道博物馆展开大搜查，但……？此时，以横川支部为目标，“黑暗新干线”来袭。没想到“黑暗新干线”竟然自行变形，变成了新干线战士Z袭击而来！

多亏阿进的灵光一闪，掌握了特奥提所瞄准的谜之结晶体“黑色晶石”所在地的线索。阿进注意到，迄今为止巨大怪物体出现的地点，都位于自古已有的街道沿线。得知此事的玄武，带领阿进等人前往东京都内各处与街道相关的景点。玄武似乎想通过曾经存在的“万世桥站”的事情向阿进传达些什么……？

在曾经的战斗中惨败于新干线战士后，基度拉尔撒斯的苍玉在寻找新的协助者。此时，他因某个契机决定回到故乡的樱岛，开始了从盛冈站到鹿儿岛中央站的普通列车之旅。另一方面，无精打采的阿进被花火和大树带出去进行温泉旅行。途中，阿进等人遇到了车体绘有凯蒂猫的新干线。

阿进驾驶“新干线战士Z E5隼号”战斗的事情被姐姐阿鲇和母亲时知道了。为了让她们理解自己所做的事，阿进邀请两人参加横川铁道文化村的“车辆涂装活动”。铁道文化村里，花火和大树的家人以及大宫支部的工作人员们也齐聚一堂。那时，细川被岛委以特别的任务。那是关于京都支部“新干线战士Z 500回声号”Z合体的重大任务……？

为了见到华丽登场的“新干线战士Z 500回声号”的驾驶员岚山银河，阿进等人造访了新干线超进化研究所京都支部。银河是所属艺能事务所的研究生，作为偶像的苗子，是位散发着闪闪发光氛围的异色少年！不知为何适合率下降，无精打采的阿进。看到这样的他，银河提出要由自己来担任团队新干线战士的“Center”，令阿进等人惊愕。

细川开发中的“载莱纳 323大阪环状线”接近完成。阿进等人开始在京都寻找Z代码，但由于“阿伯特的梦”这一线索消失了，连地点都毫无头绪。银河邀请疲惫不堪的阿进等人去看自己的演唱会。另一方面，终于与父亲·斗驰名再会的阿伯特，得知他正是黑暗新干线战士的开发者。并且，斗驰名似乎有着重大的秘密……？

决定在大宫支部召集所有驾驶员举办恳亲会。但是，斯玛特的样子很奇怪。因为敬爱的阿伯特成为了敌人而受到打击，斯玛特似乎无意识地试图封印与阿伯特相关的数据。为了让斯玛特恢复原状，阿进前往位于横川的阿伯特家。那时，因屡战屡败而战士尊严受创的瓦尔德姆，赌上自己的一切，试图与新干线战士做个了断。

细川开发中的“载莱纳 323大阪环状线”接近完成。阿进等人开始在京都寻找Z代码，但由于“阿伯特的梦”这一线索消失了，连地点都毫无头绪。银河邀请疲惫不堪的阿进等人去看自己的演唱会。另一方面，终于与父亲·斗驰名再会的阿伯特，得知他正是黑暗新干线战士的开发者。并且，斗驰名似乎有着重大的秘密……？

正在举办“铁道之日”相关活动的大宫铁道博物馆，阿伯特的母亲·白雪到访。从白雪那里得到了给阿伯特的口信，阿进尝试用各种方法与阿伯特取得联系。此时，同样在摸索与阿伯特对话方法的岛邀请阿进，阿进决定去参观在名古屋支部进行的新型新干线战士的实际运行测试。究竟那个新干线战士是……？

在横川的地下空间，阿进再次见到了驾驶黑暗新干线战士的阿伯特。阿进和斯玛特拼命呼喊试图与他对话，但得不到阿伯特的回应，并演变成了战斗。另一方面，在上野的地下空间，黄医生号与坎纳基对峙。坎纳基留下“只要黑暗新干线战士存在，人类就无法阻止特奥提”的话语后消失，并开始介入E5与黑暗新干线战士的战斗。

为了获得与阿伯特对话所需的强大实力，阿进希望作为新干线战士Z的驾驶员进一步成长。面对这样的他，玄武引荐了一位自称基度拉尔撒斯青龙的人物。据说是在过去的战斗中驾驶新干线战士，守护了地球的青龙。听说他要亲自指导修行，阿进等人充满期待，但青龙的修行与阿进等人想象的完全不同……？

德岛县大步危，岩手县远野。在两地发现了与妖怪渊源深厚的新地下空间，阿进兴奋不已。紧接着，在大步危附近出现了形似子泣爷爷的巨大怪物体。恰逢此时，爱媛县西条市花火的父亲·种火等人正在为翌日的烟花大会做准备。超进化研究所被要求应对，但四国没有新干线战士Z能够行驶的线路。究竟，有没有方法将E6小町号送入大步危……？

为了调查在远野发现的地下空间，大树和大石前往当地。得知彼此都喜欢读书而意气相投的两人，因为接下来要去的岩手县是宫泽贤治的故乡这一话题而热烈讨论。途中，在新干线中小憩的大树，做了一个与宫泽贤治《银河铁道之夜》的光景十分相似的梦。于是，梦中出现了一位金色头发的神秘少女，似乎要对大树说些什么。

团队新干线战士即将加入新的力量。其名为，由E5隼号与黄医生号进行的“超Z合体”。是超进化研究所倾尽全力开发的、拥有最高机体性能的机体。但是，要成功实现“超Z合体”，必须满足驾驶员阿进和岛风的适合率在96%以上，且两人差距在0.1%以内的严苛条件。阿进和岛风立刻开始为了配合彼此呼吸的特训，但……？

阿进和岛风努力进行“超Z合体”特训的同时，回到北方之地的苍玉，再次持续进行着没有目标的、发向宇宙的定时通信。因为得不到任何人的回复，苍玉考虑停止定时通信。但是，在北海道有一名少女正在收听他的无线电。她的名字是月野梅德尔。“新干线战士Z H5隼号”的驾驶员候补生·梅德尔，在某个人物的推动下，尝试与苍玉对话。

被逼入绝境的瓦尔德姆杀害特奥提之王夺取了“王之力”，并掳走了目击现场的塞多拉，逃往地球。得知此事的阿伯特，为了救出塞多拉而驾驶黑暗新干线战士紧急赶往地球。那时，在日本，福冈县宝满山落下不自然陨石的新闻成为了话题。前往当地调查的山东在那里看到了阿伯特的身影，惊讶地试图追上去。

在东京站中央迎击系统的力场中，新干线战士Z们与黑暗新干线战士对峙。尽管阿进等人拼命呼喊，状态异常的阿伯特却不由分说地操控黑暗新干线战士袭来。战斗中，被愤怒与无力感吞没的阿伯特，终于让特雷兰提亚爆炸了。父亲·斗驰名的祈祷也化为徒劳，拥有威胁力量的“黑暗新干线战士 恶魔模式”觉醒了……！

圣诞节将至。因在海外的工作告一段落，父亲久违地即将归来，新多家正以阿进为中心精心准备圣诞派对。此时，偶然与明野再会的阿鲇，为了获得迈向记者梦想的建议而邀请明野喝茶。但是，反而被明野追问关于新干线战士Z的秘密……？

某夜，梅德尔正在收听无线电时，伴随着不可思议的声音，不明飞行物体坠落下来。有着机车般外形的那个飞行物体，是过去新干线战士曾战斗并击退过的机械兵器·瓦尔德。或许是长时间在宇宙徘徊的缘故，车体严重劣化。梅德尔认为瓦尔德持续发出的不可思议声音具有某种意义。阿进和大树也为了支援，驾驶E5隼号和E7光辉号前往北海道支部。

根据塞多拉带来的情报，确认了特奥提的大本营“尤格司比亚”位于宇宙，阿进等人意气风发。恰在此时，曾驾驶“新干线战士 E5隼号”拯救日本的传说驾驶员·速杉隼人从英国回来了。受隼人邀请，阿进、花火、大树带着塞多拉去进行新年参拜。但是，隼人的目的似乎与普通的新年参拜略有不同……？

听说能前往位于宇宙的特奥提大本营，阿进等人前往鹿儿岛县的樱岛。那里有超进化研究所的实验线路，据说能将新干线战士Z发射到宇宙。发射时机在46小时后。并且，一次能运往宇宙的新干线战士Z只有一编组。为了与阿伯特对话，也为了探寻与特奥提共存的道路，前往发射的倒计时开始了……！

被黑暗新干线战士击败、在宇宙漂流的E5隼号，被特奥提的战士们回收了。一方面为阿进的平安感到高兴，另一方面又对原本应是敌人的特奥提出手相助感到不可思议的山东等人。此时，阿伯特的父亲·斗驰名出现了。阿进追问斗驰名为何要制造黑暗新干线战士。斗驰名给阿进看了一张照片，开始向阿进讲述自己在地球度过的日子。

在驾驶员们以及特奥提人民的守望中，E5隼号与黑暗新干线战士恶魔模式激烈冲突。为了完全接受阿伯特的心意，阿进选择了决死的战法。那时，从地球向宇宙发射了“载莱纳 E235山手号”。但是，在尤格司比亚无法启动载莱纳。究竟能否完成Z合体……！？

回到横川家中的阿伯特，等待他的是请假期间堆积如山的作业。在阿进和斯玛特的帮助下，阿伯特以猛烈的势头完成作业。他们为了寻找暑假自由研究的主题，前往碓冰峠铁道文化村。另一方面，在大宫支部，对回收的黑暗新干线战士的解析正在进行。解析的结果表明，黑暗新干线战士内部被编入了可怕的“回路”……！

某天，正在操作斯玛特的阿伯特突然大叫起来。听说斯玛特和驾驶员们的Z齿轮里，安装了一个会自动记录到访车站的“新干线收集者”应用，在阿伯特不知道的时候，已经接近完全制霸了。剩下的只有包含阿伯特式区间的静冈县·大井川铁道的各站。阿伯特干劲十足地表示“最后要靠自己的双脚记录”，阿进和斯玛特也一同享受了前往当地的旅行。

因突然出现的谜之流体，坎纳基被吞噬到地底，阿进等人说不出话。同一时间，由于瓦尔德姆的策略，黑色晶石被一齐破坏，全国各地也出现了谜之流体。是黑色晶石所封印的破坏神·阿拉巴吉复活了吗？被吞噬的坎纳基是否平安？为了应对急转直下的事态，新干线战士Z各机体紧急赶往全国各地。

因使用禁断的特奥提代码而注定战斗至死的宿命，坎纳基化为失控的暴走状态。阿伯特再次应战，但坎纳基的力量连黑暗新干线战士阿布索鲁特都能压制。与此同时，出现在全国各地的谜之流体陆续集结到富士山地底。最终所有的流体合为一体，破坏神·阿拉巴吉取回了真正的姿态……！

阿进等人发现阿拉巴吉的弱点是盐，在富士山地底展开最后的决战。为了从前所未有的敌人手中守护星球，人类、基度拉尔撒斯、特奥提携手合作。当所有的“轨道”连接在一起时，最终的绝招“双重Z合体”发动！新干线战士Z，最后的出发前进！