第 2 季

号称“医龙”的朝田龙太郎在带领医龙小组，完成了日本第一例 Batista 手术后就解散了小组，回到难民营继续行医，没有了医龙小组的明真大学附属医院病人急速减少。当初争夺教授之位的加藤晶和雾岛军司也都离开了。伊集院登、里原美纪和木原毅彦等人虽还留在医院，却都因为医院生意不佳感到了不安。此时一封来路不明的电邮提出希望明真重组医龙小组，但龙太郎不在日本，藤吉圭介在地方医院上班，麻醉师荒濑门次虽然也留在明真却毫无霸气可言，伊集院对重新组队不太抱希望。与此同时明真为了重振医院，从前与医龙小组为敌的野口贤雄，作为拥有包含教授在内的所有医局成员生杀大权的部长回来了。于是伊集院越发希望重组医龙小组了。野口还借机下放了对伊集院不满的江上彰教授。不久片冈一美被紧急送到明真救治，适时出现的龙太郎为她做手术挽救了停止心跳的她。重组医龙小组不再只是梦想，藤吉也出现在了兴奋的伊集院和众位成员面前。患者富坚由佳理希望接受心脏手术，但因为她已经怀有7个月身孕所以所有医院都不肯给她做手术。而她的身体状况并不允许她怀孕，因此其夫富坚刚也拒绝妻子怀孕。藤吉认为这个手术毫无疑问只有龙太郎能做。这个手术无疑危险系数非常高，所以龙太郎也拒绝了。但被龙太郎救了一命并坚信他有这个实力的片冈，假装成医疗记者试图说服龙太郎答应做这个手术。

成功重组医龙小组的人，是北洋医院的老板片冈一美。在外资的投资公司担任重要角色的片冈，融资了陷入经营危机的北洋医院，掌握住了这家医院的营业权，并提出和明真大学附属医院业务合作，即是说把优秀的医生送往明真，而北洋则负责接收明真这边没钱的患者。这样是为了打破北洋专门接收有钱病患的陋习。按照片冈的计划，希望能在三年后建成心脏移植手术的领头羊大规模医院，这和野口贤雄的构想不谋而合，于是两人一拍即合。野口把自己的构想告诉了龙太郎，他认为龙太郎的医龙小组是这个计划中不可或缺的核心。然而龙太郎相当反感野口这种把医院收益放在首位的做法，并言明自己在美国学习心脏移植术是为了医治患者，而回国的目的则是重新组成医龙小组。野口虽然保证会不遗余力地协助他，却也冷然地告之自己的计划是不容许任何人破坏的。某天，明真来了一个叫做西泽孝文的老年病患，他的孙子翔太也一起出现。西泽一直声称自己心脏不舒服，照看他的护士却查看了许多次也没发现问题。翔太愤然指出几年前西泽曾在明真接受手术。可惜内科医生却告之明真已经变成专门医院，西泽将被送往北洋医院。北洋医院的院长善田秀树来找野口，两人因经营理念不同发生口角。晚上野口召开了记者招待会，并公开了自己的构想，但龙太郎却没有出席。

医龙小组的三名成员龙太郎、伊集院和藤吉，不满野口贤雄对年老患者西泽孝文的处理方式，随其一起转到了北洋医院。小组里还留在明真大学附属医院的成员，就只剩下荒濑和美纪两人了。龙太郎告诉北洋医院的院长善田秀树，自己会组建新的医疗小组。从以前开始就相当不满片冈一美和野口贤雄策略的善田，在两人面前声称会为了龙太郎改变北洋。可惜这依然无法阻止两人逐步推行自己的计划。这天龙太郎终于为西泽动手术了，西泽的术前评价是在明真进行的，召集参与手术的人员的伊集院却请不动麻醉医师高七海。外山诚二来到手术室表示希望能主刀，于是龙太郎作为外山的第一助手，手术正式开始。另一方面，藤吉从美纪那里拿到了西泽在明真的手术记录备份，发现了野口反对西泽再次接受手术的理由，于是藤吉得知这次的手术很难成功。打开患者胸腔的龙太郎，对认为是肿瘤的部分进行了切除，没想到手术后西泽出现了不适的现象，他的体内存留着止血棉纱。结果再次动手术的结果，是被外山损伤了心尖部分，西泽开始大量出血。

虽然龙太郎都转到北洋去工作了，这里的病患却并没有增加。善田向藤吉询问关于医疗小组组建的情况，却得知人员相当难确定。龙太郎很看重麻醉医生小高七海，上次给西泽做手术的时候，小高一直准确无误地给年轻的麻醉医师做指导。龙太郎于是想知道她明明拥有很强的能力，却至今未曾参加过手术的理由。此时小高吃下了巧克力导致食物中毒。“北洋已经没有有能力的医生了”，这样的传闻就连女高中生都知道，因为肚子痛被救护车送到北洋来的矢泽真理绘，要求到明真接受治疗。真理绘是患了急性阑尾炎，外山却指出自己去做这种小手术，是对自己的侮辱，惹得愤怒的龙太郎对他大吼。当龙太郎正在为真理绘施行手术的时候，鬼头在明真已经组成了属于自己的医疗小组“鬼头小组”，荒濑也加入了这个小组。片冈为了给明真添置实施心脏移植的设备，当晚请以前的福利劳动大臣恩田哲三吃饭。于是明真终于得到了这项许可。北洋这边，矢沢真理绘接受了手术之后恢复得很快，这天朋友绪方美羽来看她，真理绘对为自己执刀的龙太郎赞不绝口，并告诉美羽如果肚子疼就去找龙太郎看看，可惜美羽却没能跟龙太郎说上话。

续方美羽因信任龙太郎住进了北洋医院，但当得知美羽是议员恩田哲三的女儿后，一美和野口把她转到了明真大学附属医院。最终决定由鬼头笙子的医疗小组给美羽做手术，却得知美羽的血型是极罕有的类型，手术的危险性让野口烦恼不堪。美羽擅自离开了明真去找龙太郎，在北洋医院门口昏倒，结果被紧急送进了手术室。与此同时野口打电话把美羽的情况告诉了其父恩田，并强调美羽的手术除了北洋没人能做。此时北洋方面正在紧急为手术做准备，严肃的气氛让野村博人感到恐慌。藤吉拼命寻找和美羽同样血型的鲜血却始终找不到，麻醉医师想起伊集院曾为一个有同样血型的患者执刀过，于是伊集院赶紧去登门拜访这个叫门胁的男子。但此时情况已经危及到没办法等血送到了，龙太郎要求外山诚二做助手立即开始手术。但由于不能输血所以整个手术只能持续 40 分钟。虽然龙太郎对自己的技术充满信心，但却没有任何人相信他的话。毫不介意别人的想法，龙太郎以惊人的速度开始进行手术，途中却发生了重大的事故。美羽的患处比检查时扩大了许多，手术根本没可能在 40 分钟内完成。

众人都知道北洋医院有个天才外科医生朝田龙太郎，每天慕名而来的患者络绎不绝，虽然病人增多了，却也让龙太郎没精力去组队了。外科医生外山诚二要挟龙太郎，要求加入这天的心脏手术成为其成员，龙太郎却以外山还不足以成为一个医生而拒绝。伊集院从野村博人那里听说外山是某大学著名教授的儿子，他的弟弟也在该大学就职，简言之他们是一个优秀的医生家庭。野村对外山的现状并不乐观，对他的推测伊集院也认同。藤吉从龙太郎处得知小高七海依然不肯参与手术，之前那个少女的手术她之所以参加，是被片冈一美说服了。北洋的所有医疗人员都知道龙太郎在追赶时间，全部前往手术室旁的观摩室。外山冷眼目送他们的行动时，接到了有救护车紧急送病人过来的通知。被送来的患者名叫五代明代，其夫昭三要求龙太郎执刀，接电话的人指出龙太郎正在动手术断然拒绝，外山连忙抢过电话一口答应。结果明代被送到医院的时候，是外山迎接并自荐要为其做手术。龙太郎的手术终于结束，护士把外山正在给病人动手术的消息告诉他，当龙太郎和集院急急忙忙赶过去的时候，却看到不停大笑的昭三，和手术飞快结束满脸得色的外山。在明大附院，鬼头笙子小组主持的肝脏移植手术不断获得成功，野口为此志得意满，并开始为医院心脏移植获得认可做准备。

外山诚二也加入了龙太郎的医疗小组，但麻醉医师小高七海依然兴趣缺乏。此时称松平幸太郎为“超级医生”的少女高见香奈，和她的母亲高见纪枝来到北洋。松平已经几年没有拿过手术刀，这两母子却对他的技术充满信心，让伊集院等人甚至龙太郎都感到不可思议。但随后藤吉却调查出，松平曾成功施行了母子之间的活体肝移植手术，所以纪枝是来拜托他把自己的肝脏移植给女儿香奈的。实际上纪枝之前曾在明真接受治疗，她因患有食道癌所以肝脏机能低下，如果要作移植手术则风险很大，野口贤雄下令她的主治医生荒濑要求她转院到了北洋。此时松平正在查看纪枝的B超图片，善田指出手术成功率很低，松平却始终沉默不语，纪枝一直希望由他来给自己动手术，心理负担不断增大的松平忍不住喝了比平时更多的酒。最终北洋接受纪枝入院，虽然众医生都指出应该尽快做手术，松平却决定给她实行放射和药物治疗，尽量避免动手术。只有善田明白松平避免手术的原因，他在拥有神乎其技医术的龙太郎面前充满了自卑。

北洋医院来了一个少年病人，他的父母都希望龙太郎为儿子医治，这个孩子叫做黑田智树，其父俊彦是专门处理医疗纠纷案的律师，智树因麻醉医师的错误患有脑部缺氧症，因此俊彦对跟手术有关的医生极度敏感。从龙太郎那里得知此事的藤吉，答应会事前提醒参加手术的医生们。俊彦固执地要求龙太郎和藤吉，不能让小高七海一起参加来给智树动手术，并道出了必须这么做的原因。原来小高就是智树的亲生母亲，她结婚的时候还是学生，虽然生下了智树，却因为作为麻醉科医师太忙没时间照顾孩子，就连智树生日那天，她明明和儿子约好早点回家，却也因为有紧急手术而失约，当小高回到家时一直等着她的智树，已经因为哮喘发作被父亲俊彦送到了医院，结果因为那家医院麻醉医师的疏忽，智树患上了脑部缺氧症导致下半身瘫痪。此后俊彦就因此憎恨小高并与之离婚，迎娶了孩子的复健指导老师早苗为妻。龙太郎开始给智树动手术了，经俊彦的允许，小高可以在外面的观摩室观看整个过程。

一个名叫英部美和的女人带着年仅 9 岁的儿子雄太，到北洋医院来找龙太郎。龙太郎告诉医龙小组的成员，雄太两年前接受了自己施行的 Batista 手术。雄太是龙太郎在非洲充当志愿者时认识的海外青年志愿者队成员的儿子，患有严重的扩张型心脉症，当时在当地没有其他方法只能给孩子动了手术。但经过几年后现在他的心脏机能已经恶化。美和两夫妻虽然也曾考虑过给孩子移植心脏，可惜却因为费用太高望而却步。雄太的父亲已经因疲劳过度去世，只能指望龙太郎的高超技术了。如果持续现在的状态，雄太就只剩下两个月的生命了，在日本要给小孩子做心脏移植手术是万分困难的，龙太郎不得不和藤吉把这一点告诉美和，受不了刺激的美和冲到了医院后园去。藤吉把雄太的现状告诉了看着美和的片冈一美，并告诉询问解决之道的一美，手术成功率只有 1%，不只是患者亲人赌不起，医生们也没可能答应动手术。这天晚上龙太郎在中庭看到了正独自练习手术的伊集院，他希望自己能拥有龙太郎和外山那样高超的技术。

龙太郎为野口贤雄做的手术成功了，但当初龙太郎答应给野口做手术，是向片冈一美提出了交换条件要带领医龙小组回到明真的，野口却拒绝更不再和片冈继续合作。并向龙太郎提出如果要返回明真，就必须连音部雄太的手术也成功。接受这个条件的龙太郎带着医龙小组暂时返回明真。带领鬼头小组的鬼头笙子即将给 VIP 病人山野文彦执刀，龙太郎也开始给雄太诊治。虽然现在医龙小组已经有了包括小高七海在内的一帮医术高超的医生，但和鬼头的病患相比，要给年仅 9 岁的雄太做心脏移植成功机率实在太低。龙太郎却丝毫不理会成员们的忧心忡忡，不断催促他们赶快为手术做准备。这天龙太郎命令伊集院加入鬼头小组，并告诉为此不满的伊集院，鬼头的手术在先，希望伊集院借机先学习然后再为雄太的手术做准备。另一方面，野口在得知伊集院要加入鬼头的小组后笑得合不拢嘴，他认为如果雄太在找到合适的心脏以前就死亡，龙太郎就没借口再回明真了，而能把年轻有为的伊集院留在明真则是最理想的。

原本要给鬼头笙子医疗小组病患的心脏，最终因患者山野文彦拒绝手术，决定把心脏给医龙小组的 9 岁患者音部雄太。野口决定在松平幸太郎给雄太施行活体肝移植手术的同时，龙太郎给雄太施行心脏移植术。很快手术开始了，所有医护人员都聚集在一起紧张地关注着手术，久违的雾岛军司突然出现在人群中。负责去取移植用心脏的伊集院遇到了麻烦，他困在了山里，得知这个消息的片冈一美赶紧派出了直升飞机。移植用心脏及时拿回来了，虽然心脏移植手术一度出现问题，最终还是顺利结束。手术成功了，在庆功宴上野口不断夸耀自己的功绩，正当他说得口沫横飞的时候，背后的大屏幕却开始曝光野口的丑闻，一时之间周围的人哄堂大笑，野口则狼狈不堪。把雄太送进 ICU 房间的龙太郎和伊集院在山野的帮忙下见了鬼头，山野文彦指出雾岛军司持有将来会取代真心脏的人工心脏，鬼头和雾岛将联手拯救一个生命。几天后，在野口以前的办公室里，片冈一美向善田秀树提出了全新的经营方针。明真将成为全能型的综合医院，北洋也将做出相应调整。