第1季

1937年8月，淞沪会战开始，中日战争全面爆发。中日双方投入重兵，激战一个月后，双方均伤亡惨重，战事呈胶着状态，日本“三月亡华”的计划落空了。为了快速解决战斗，日军参谋本部决定，增派三个师团与海军协同作战，在杭州湾北岸登陆，从后面包围中国军队。作战命令以最新设计出的顶级军事密码发给了上海派遣军松井石根大将，同时派遣特务侦察登陆地点中国军队的防务，做好登陆的先期准备。

危急时刻，惠子以精准的枪法掩护芳子离去。孤军奋战的惠子准备与王浦江做鱼死网破的最后一搏，正当她准备举枪自尽时，芳子率接应的日军间谍赶到。被惠子打伤的王浦江只能眼睁睁看着惠子被同伙抢走。根据惠子和芳子的情报，日军参谋本部决定了具体的登陆地点。

青天秀的来访打拢了文为均的演算，最终输给了山本康夫，这也意味着他必须履行诺言。晚上，在山本康夫和青田秀约定的玫瑰餐厅，山本康夫带着玫瑰花和求婚戒指赶到，当着众人的面跪倒向青田秀求婚。

山本康夫如愿以偿地成为东京帝国大学的数学系教授，而应邀而来的文为均却没得到任何的音信，这让青田秀产生了怀疑。

1928年，国立东南大学改名为国立中央大学。文为均受毛祖和的邀请前往国民党军事委员会，此时委员长已经同意在中央大学数学系设立密码专业，张诚将军亲点文为均为系主任。

惠子和芳子为了能加入陆军中野学校擅自偷出山本康夫的印章，在家长同意书上盖了章，参加了中野学校的考试。经历了一道道近乎非人的残酷测试后，惠子和芳子两姐妹都被中野学校录取了。

文为均再次出现在中央大学已是一身戎装，成为了军委会密电所所长，中将军衔。他的任务是二十四小时监听日军情报，尽最大努力，力求全面准备掌握日方所有信息，张诚将军为他提供了一切便利。

青田秀被山本康夫接出了监狱，日本军国主义势力的无可逆转，甚至连自己女儿的命运也改变不了，丈夫也被一只无形的手拽着，逐渐走向战争，她已心如死灰。

一场“负心”行动开始了。林平再见到王浦江的时候，他已是一身戎装，面对林平吃惊的眼神，他把将自己调查局特务的身分“如实相告”。

山本五十六与山本康夫深谈，告诉他只有靠战争才能让大日本帝国变得强大，而他的才智只有在这场战争中才能得到最大的发挥，做为一个日本人，这也是他应该做的，听到这里山本康夫陷入了思考。

南京城外，守军正浴血奋战，但双方力量悬殊，各条防线相继告破。林忠强亲自冲上阵地，率队与日军搏杀。但大批日军已涌入城门。林忠强终于战死在阵地上，南京城陷落了。

1940年，随着作战地区的不断扩大，日军侵华战争陷入持久作战的泥潭。同时也激化了与英美的矛盾，重要战略物资的进口受到限制，日本国内经济受到严重影响。

军委会张诚将军对于日军的轰炸极为震怒，他意识到密码的破译工作越来越重要，因此他以军委会的名义发出了命令，将国民政府所有的密电机构统一合并进军委会密电所，文为均任所长，黄永青任秘书长兼破译组组长，郭忠良则成为了破译组副组长。

根据毛祖和提供的情报，密码破译已有了突破性进展。破译工作迫在眉睫，在黄永青的提议下，军委会成立了专项小组，黄永青任组长，郭忠良任副组长，全力破译密电。

密电所的破译又有新的进展，林琴有了文为均颁发的特别通行证，可以随时出入密电所的核心---黑室，这也让密电所的关系更加微妙。

川岛和惠子也在看热闹的人群中，他对惠子的警觉与果断极为钦佩，并袒露了自己对她的爱意，但惠子却冷静的告诉他，他还不如自己手里的一支手枪。

身为密电室副主任，韦国平却没有进入黑室的权力，这也让他大为光火，他单独约见林琴，提出和调查局合作，但于公于私林琴都无法接受，她委婉地拒绝了。

深夜，韦国平家。韦国平与妻子胡茵梅乔装而出，来到了一间密室。韦国平让妻子以郁金香的名义发出了一份电报――“下雨了，换把伞”。

郭忠良虽然监听到了广播的内容，但对这些暗语一筹莫展。文为均对山本康夫和日本文化非常熟悉，终于，黄永青在文为均的提示下从暗语中猜出了对方的接头地点，但离接头时间已所剩无几。

一个月之后，历经艰辛的小野平终于又回到了日本，芳子百感交集，紧紧抱住了失而复得的爱人，而小野平却表现出了冷漠，芳子和姐姐长得太像了，每当看到芳子，他都会想起惠子的残忍，而作为一个日本男人，自己在战场上表现出的懦弱，又使他的自尊受到了打击，面对双重的煎熬，他终于向芳子提出了分手。

林琴发现，密电所中存在很重大的安全隐患，每天收集的密码由郭忠良保管，第二天才送到文为均和黄永青手中，林琴将此事告诉了毛祖和，虽然还没有什幺疑点，但此人没有任何污点与破绽，甚至连感情流露都极为罕见。他工作非常努力，和所有人都保持良好关系——这样近乎完美的人，是不正常的，林琴直觉告诉她，郭忠良应该有秘密。

紫光一号的成功破译，使调查局加快了控制密电所的步伐与力度。厉主任催问“紫光二号”的破译时间，并对密电所的破译水平提出了置疑，并把聘请外国专家的事宜提到日程上来，这使文为均君和黄永青大为恼火。厉峰的提议表面上是为了加快密码的破译，其实更深的意味是，外国专家的到来意味着调查局将会直接接触密码的破译工作。

对于林平的再次出现，毛祖和也很高兴，林忠强的两个女儿终于都平安了。他举行家宴庆祝林平的归来，文为均、黄永青带郭忠良前来祝贺。饭后，毛祖和与文为均促膝长谈，告诉他调查局将聘请美国专家的事，而他没想到的是，心存坦荡的文为均欣然接受。

山本康夫决定，亲自前往香港，会一会文为均和钱德勒两个老朋友，如有机会，他会劝说二人为日本服务，否则文为均只有死路一条。

林平在密电所门口等郭忠良下班，正赶上出来的王浦江，一对昔日的恋人终于相遇。两个曾经的恋人长久无言对视。王浦江知道林平的真实身份，他的任务之一正是要保护她和郭忠良的安全。

韦国平开车来到了电台所在的四合院门口，他让胡茵梅在门口盯梢，自己进屋抢出了电台。韦国平开车撤离，但此时调查局的宪兵和特工已将各个路口全部封锁，他只有冒死闯关。

文为均与钱德勒单独会面，钱德勒答应与文为均一同前往中国。文为均截获的将紫光二号的资料交给钱德勒，钱德勒很清楚，这是文为均对自己的测试，他拿到这些资料，开始研究。

酒店包房内，山本康夫告诉青田秀，他并没有希望文为均能背叛自己的祖国，他们正在完成一个不可能完成的任务。

这一些被屋内的青田秀听到，她找出了山本康夫的日记，看见里面夹着当年在美国三人的合影，青田秀心情复杂，她决定把这本日记交给文为均，希望他能在其中找到破译思路，同时也对自己的爱情做最后的终结。

黄永青心情悲痛地回到了密电所，继续破译，这是他现在唯一能做的。在香港的文为均对国内发生的事一无所知，他在给钱德勒做最后的测试。钱德勒直言不讳，如果自己破译了紫光密码，文为均的地位将会动摇，因此他认为文为均不会欢迎自己的到来。

韦国平来到黄永青的办公室，谼接手林平的工作，但黄永青表现得非常镇定，平静地拒绝了韦国平的要求，搞得韦国平灰头土脸。黄永青突然变得睿智，这让厉峰意识到这是毛祖和在背后指使，无奈之下，韦国平建议对林琴用刑。

面对文为均――自己的好友、情敌，山本康夫心情复杂，他冷漠地告诉文为均。希望他退出密码破译以保全性命，他不希望自己最好的朋友被暗杀。

舞会结束，芳子陪钱德勒回到了房间。小野平再也抑制不住内心的感情，他将高桥的给芳子的任务告诉了山本康夫和青田秀。听到这个消息，但此时山本夫妇大为震惊，但此时已经无法接近芳子。

第二天在机场，山本康夫假装腹痛，支开高桥，青田秀顺利地买了去美国的机票，但还是被警觉的高桥发现，他派出特工在机场搜寻青田秀。青田秀一直躲在机场的警察局内，但中日并未开战，香港警察也艾莫能助，无助的青田秀拨通了文为均的电话。

调查局内气愤紧张，黄永青寸步不让，厉峰态度坚决，谈判陷入了胶着，而韦国平的手下已经用床单勒住了林琴的脖子。林琴命在旦夕之时，厉峰接到了蒋委员长的电话打来了电话，下令要求厉峰释放林琴。终于，将死的林琴逃过一劫。

调查局内气愤紧张，黄永青寸步不让，厉峰态度坚决，谈判陷入了胶着，而韦国平的手下已经用床单勒住了林琴的脖子。林琴命在旦夕之时，厉峰接到了蒋委员长的电话打来了电话，下令要求厉峰释放林琴。终于，将死的林琴逃过一劫。

回到日本的山本康夫被监禁，他以绝食的方式做最后的抗争。此时的山本康夫已心灰意懒，一心求死，面对高桥的威逼，小川的利诱都没法让他继续工作，更没有告诉他们青田秀交给文为均的东西是什么。痛苦中的山本康夫唯一想见的人只有自己的表兄山本五十六。

山本五十六如约而至，面对极度消沉的表弟，山本五十六面沉似水。面对自己现在唯一的亲人，山本康夫将青田秀将香港发生的一切告诉了表兄。山本五十六虽然很愤怒，但他知道，此时的表弟已经心如死灰，抬起的手渐渐收了回去。

厉峰约见钱德勒，询问紫光二号的破译情况。钱德勒告诉厉峰，钱德勒告诉厉峰，破译进程很顺利，这些都得益于文为均提供的协助，特别是郭忠良的努力，但对破译的细节钱德勒却闭口不谈，而且他也无法给出具体的破译时间。

在美国，史密斯上校派特工跟踪青田秀，发现在书店中，青田秀曾经翻阅过《简爱》，他命令手下的特工拿来了这本书，把青田秀要发给钱德的数字与书中页码一一对照，却没有发现任何线索，他终于决定帮青田秀发报给钱德勒。

毛祖和新官上任，第一个召见的就是厉峰。厉峰心里很清楚，毛祖和为林琴的事早已把自己当成了眼中钉，他表面向毛祖和谢罪，其实却是在告诉毛祖和，如果他刚刚上任的第一把火就烧到调查局头上，别人会说他公报私仇。

夜晚，林平来到毛祖和家，但他还没有下班。林平和林琴深谈，她告诉姐姐自己知道他和郭忠良的身份，但现在的毛祖和已不比从前，不一定能保护她。此时，毛祖和正好回来，她知道林平就在林琴房里，林琴告诉他林平不是共产党，但毛祖和却让林平去调查局接受审查。

山本康夫得到女儿芳子阵亡的消息无比悲痛，小川将军谎称芳子是被中国军队残忍杀害的，想以此来激起他的斗志，但山本康夫早已心如死灰，他现在唯一剩下的只有惠子了。山本五十六突然驾临，他对芳子的殉国同样痛心。此时紫光二号的情况极其危急，山本五十六十分恼火，如果紫光二号被破，只有提前启用紫光三号。

小野平成功抵达重庆，这回还是由惠子接应。小野平这回的计划是诬陷文为均，按照计划，他来到文为均家与文为均联络，将山本康夫写的劝降信交给文为均，还有当年文为均在日本的照片。文为均看出了他的来意，他找来特工将小野平带走。

林琴和郭忠良将黄永青扶进屋，林琴终于可以和他在一起了，但此时的黄永青却已经没有了呼吸。日本特工的人数越来越少，惠子并没有像以往一样撤离，这次她抱定了必死的决心，最终，她还是倒在了老对手王浦江的枪下。

山本五十六机毁人亡。日本政府举行隆重的国葬。第二天，山本康夫回到家乡，在家人的灵位前，这一次，他终于成功地挥刀自尽。青田秀最终没有跟文为均在一起，他决定一生一世都不离开丈夫，而现在她能面对的只有亲人们的灵位。1956年，文为均回到中国，郭忠良、陈克、林琴、王浦江等人在机场迎候，他们共同成为新中国密码事业的奠基人。全剧终