第 1 季

天才法医学者水泽真澄从美国归来，加入厚生劳动省新成立的法医学专门团队MEJ，与对法医学和案件搜查几乎一窍不通的中心长桐生麻帆搭档。MEJ启动次日，两人便前往现场调查一名17岁少年在水深40厘米的池塘中死亡的案件，刑警堂岛穗乃果判断为他杀，而真澄则冷静观察现场并开展团队首次解剖。解剖确定少年死因为溺死，但尸体上既无意识丧失痕迹也无抵抗痕迹，这场死亡的真相成谜，真澄、麻帆与MEJ团队的挑战就此展开，他们将循着遗留下的痕迹探寻真相与背后的情感。

MEJ 虽已启动，工作人员却被大量文书工作困住，难以专心开展解剖，氛围十分压抑。本田与旧友广野聚餐叙旧，对方态度异常，聚餐后次日广野便被发现离奇死亡。现场看似坠落致死却无高层建筑，解剖结果也确认死因为坠落，谜团重重。众人不禁疑惑，广野究竟从何处坠落、又为何会遭遇不测。

一天夜里，MEJ 接到电话，得知造船厂社长伊泽康雄疑似被卡车撞死。水泽真澄与桐生麻帆赶往现场，堂岛穗乃果等人发现多处疑点，死者被撞距离过短却留有车辆加速痕迹，却缺少关键证据。本田雅人等年轻法医与检验技师参与解剖并交换意见，结果显示一种可能性浮现，但死者并无防御痕迹，与现场证据矛盾。次日，真澄二人发现卡车司机田村和寿身亡，其口袋留有疑似遗书的纸条，重重矛盾背后，另一重真相逐渐浮出水面。

MEJ 中心主任桐生麻帆接到曾致力推动的 “年轻人贫困支援项目” 启动的通知，却因职务所限只能交由他人负责而失落。此时 MEJ 接到俱乐部老板栗山隼人的可疑死亡通报，麻帆与水泽真澄前往现场，演员柳原美幸自首称因被暴力支配而毒杀、绞杀并溺死了老板，供述与现场及解剖结果一致却对毒药闭口不谈。然而，俱乐部的黑服村野尚树随后也自首，称是自己用烟灰缸殴打并绞杀了老板，其供述与老板头部的殴打痕迹相吻合，两人重叠的自供让真相变得扑朔迷离。

MEJ 的休息室里，法医学者高森莲介即将当爸爸的话题正热闹。此时，一桩“活人鉴定委托”突然到来——10岁少年奏太在楼梯下昏迷，留下“黑色怪物”的留言，身上还有疑似虐待的伤痕。高森因自己也曾是虐待受害者而双手颤抖，嫌疑落在同样有创伤史的恋人纪田谅司身上。在真澄和麻帆的鼓励下，高森直面“虐待连锁”的阴影，追查少年恐惧的“黑色怪物”真相。

松原凉音的姐姐早纪被爆出与国会议员青田敏夫存在不伦关系，而早纪随后竟成了青田吊死案的第一发现人。经解剖发现青田并非自杀，尽管面临各方施压，凉音仍请求参与调查以查明真相。她虽一直讨厌擅长“察言观色”的姐姐，却坚信姐姐绝不会做出伤害他人的事，决心揭开事件背后所谓的“空气”真相。

在一档人气综艺的20周年庆典上，主持人天城耕一意外坠楼身亡，但遗体表面几乎没有外伤，法医水泽真澄和桐生麻帆察觉到极不自然，解剖后更是发现了“仿佛只有身体内部经历了坠落”的离奇状况。警方高层试图将此案草草定性为自杀，但真澄从死者精确到分钟的行程表中发现端倪，并逐步揭开了天城与昔日搭档、节目导演武藤和彦之间变质的关系。面对上层的施压，MEJ 团队能否查明这位曾经的追梦人为何性情大变，以及这场“仅内部坠落的死亡”背后的真相？

MEJ 在调查一起郊外火灾案时，发现为救女儿葬身火海的母亲遗骨旁，本该一同遇难的女儿却离奇失踪。随着调查深入，团队不仅发现了丈夫与亡妻好友的秘密接触，更对母亲拼死救女背后的真相产生了巨大疑问。为了寻找那个消失的小生命，MEJ 全员开始在焦土与资料中展开缜密追查。

一名75岁老人在公寓内孤独死，现场留下的“绝不原谅”字条让警方怀疑其为他杀。水泽真澄与检查技师吉本由季子从现场的细微违和感中，拼凑出了死者须崎秀夫不为人知的生前轨迹。与此同时，真澄在看守所里也迎来了一场关键的会面。

MEJ 突遭闭锁后，失去权限的天才法医水泽真澄在调查一起新发现的命案时，怀疑其与十五年前恩师主导的悬案及检方的施压有关。面对警方试图驱赶，他以案件间的潜在关联成功引起负责刑警的注意，并坚信“真正的犯人”已经再次行动。即使失去搭档与权力，真澄依然坚持不屈服于巨大强权，只为还原遗体留下的真相。这场法医学者为逝者（LOVED ONE）坚守正义的最后抗争就此拉开序幕。

15年来，法医学者水泽真澄始终无法忘记导致芹泽真一被判死刑的“白峰女子连续杀害案”，并开始重新调查案件真相。随着麻帆等人重查证据、前往案发地寻找线索，众人逐渐发现当年的判决或许存在重大问题。与此同时，一起新的连环杀人案尸检结果让真澄察觉到与白峰案相关的关键异常。跨越15年的隐瞒与误判背后，真正的凶手和悲伤真相即将浮出水面。