第 1 季

异人馆村是一个隐藏着惊人秘密的村庄，六大家族与牧师一家曾经秘密栽培大麻，由此发家致富。然而，牧师因为收养了7名孤儿并为了孩子们的未来着想，主张停止这种非法行为并打算报警。这一决定触怒了六大家族，他们射杀了牧师夫妇，并将7名女孩关进教堂放火烧死，留下了七具各缺少一部分的干尸。

阿一和美雪从同学那里拿到了邀请券，前往湖畔酒店。但紧接着，就传来了附近监狱中的杀人魔杰森越狱的消息。不久之后，一位受邀客人被发现死于他杀。更糟糕的是，电话打不通了，唯一与外界相连的吊桥也被炸毁了。完全孤立的客人们陷入了恐慌。

阿一和其他推理研究会的成员们为了帮助戏剧部，决定在孤岛上的酒店进行合宿。他们要上演的剧目是《歌剧魅影》，这关系到他们在竞赛中能否获胜。然而，在这个时候，独自一人在舞台上排练的织绘，却意外地被照明设备压在下面不幸身亡。以此为开端，仿佛模仿《歌剧魅影》中的情节一般，接连发生了多起悲剧……。

在传说中沉睡着20亿财宝的秘宝岛上，人们发现了一件指示财宝位置的古老屏风，于是组织了一次寻宝之旅。阿一和美雪也决定参加，前往秘宝岛。然而，当他们到达岛上时，迎接参与者的却是秘宝岛主人的惨死之躯！

阿一被数学老师小野指示参加一个只聚集成绩优异学生的特别班级的暑期补习班，不知为何。在特别班级中，最近频繁发生恶劣的恶作剧，小野希望阿一能找出犯人。就在这时，同班同学古谷被发现以自缢的方式死亡。现场留下了一张写有“地狱的摇篮曲”的威胁信。

被剑持警部邀请，阿一和美雪来到了举行“生首祭”的“无口村”。剑持的老朋友，也就是无口村的名门巽家的女当家紫乃，似乎收到了一个自称“猎头武士”的人物送来的威胁信。威胁信上写着“在祭典开始之前，要割下下一代当家的头颅”。而且，正如信中所言……。

阿一、美雪和剑持决定参加一个在迁移到日本的中世纪德国巴尔特城堡，俗称“蜡像城堡”中进行的推理游戏——“推理之夜”，游戏的赌注是城堡的所有权。其他参与者也是从世界各地聚集而来的知名人士。刚到达，参与者们就被引导到城堡内的大型客厅，并对那里排列着的自己的蜡像感到惊讶。不久，第一个事件发生了。一个参与者当麻的蜡像被刀子刺穿。紧接着，当麻本人被发现以与蜡像相同的刺杀方式死亡。参与者们被关在了场内。“神秘之夜”原来是主办者Redrum所策划的杀人游戏！

阿一、美雪和剑持决定参加一个在迁移到日本的中世纪德国巴尔特城堡，俗称“蜡像城堡”中进行的推理游戏——“推理之夜”，游戏的赌注是城堡的所有权。其他参与者也是从世界各地聚集而来的知名人士。刚到达，参与者们就被引导到城堡内的大型客厅，并对那里排列着的自己的蜡像感到惊讶。不久，第一个事件发生了。一个参与者当麻的蜡像被刀子刺穿。紧接着，当麻本人被发现以与蜡像相同的刺杀方式死亡。参与者们被关在了场内。“神秘之夜”原来是主办者Redrum所策划的杀人游戏！

金田一受学姐樱木的邀请，加入不动高中的神秘现象研究会，力图解开这七个不可思议的谜团。在接到樱木学姐兴奋的电话，告知他们已经解开谜团之时，金田一和学校警卫在新校舍看到学姐被吊死在旧校舍的生物教室。但当他们赶到之时，却发现生物教室什么都没有。然而，第二天一早，生物教室却出现了悬挂着的樱木尸体。紧接着当天晚上，尾上贵裕在查看樱木留下的文件时也不幸死亡，手中还攥着生物教室的钥匙。

金田一受学姐樱木的邀请，加入不动高中的神秘现象研究会，力图解开这七个不可思议的谜团。在接到樱木学姐兴奋的电话，告知他们已经解开谜团之时，金田一和学校警卫在新校舍看到学姐被吊死在旧校舍的生物教室。但当他们赶到之时，却发现生物教室什么都没有。然而，第二天一早，生物教室却出现了悬挂着的樱木尸体。紧接着当天晚上，尾上贵裕在查看樱木留下的文件时也不幸死亡，手中还攥着生物教室的钥匙。