第 2 季

在逃离纽约之后，马丁与杰克辗转抵达洛杉矶，一大子儿还弄不清在这座陌生的城市里等待他们父子俩的究竟是什么生活。刚到地方，他们就立刻撞见了阿米莉亚的母亲露西·罗宾斯。露西为寻找自己的女儿已经足足奔波了三年，这次与马丁的相遇让她重燃希望。然而，这段盟友关系从一开始就绝非风和日丽——露西为了追查阿米莉亚的下落，愿意做出任何事情，而这恰恰可能埋下两人冲突的种子。

马丁与露西逐渐意识到，阿斯特公司的天才数学家卡尔文·诺伯格是找到阿米莉亚的关键人物。因为卡尔文最近正处于舆论的风口浪尖，周围道道设防，马丁和特雷弗认为，要接近他就必须从卡尔文身边人入手，而突破口便是他的搭档维卡什。尽管马丁最终成功找到了维卡什，却发现自己必须先帮维卡什完成一项私人使命，以此换取对方的信任。

马丁为揭露阿斯特公司险恶本质的行动引发了一系列横跨全球的剧烈震荡——一名阿斯特公司员工在巴基斯坦越境时酿成了国际性危机。与此同时，冷酷无情的宗教极端分子吉列尔莫·奥尔蒂斯继续追踪着所谓的“三十六义人”。另一边，杰克则引着露西找到了一名女人，而这女人与露西的女儿阿米莉亚之间竟然有着惊人的交集。

阿斯特公司内部突如其来的变故迫使马丁做出了一个如履薄冰的决定——他必须与一个完全没料到会合作的对象达成交易。与此同时，露西带着新掌握的绑架案相关线索去见了警察。而在纽约，阿夫拉姆偶然间发现了吉列尔莫的踪迹，他立刻向马丁与杰克发出警报：危险的狂热杀手正在步步紧逼地搜索并狩猎他们。

杰克联系上了阿米莉亚，并给出了一个确切的会面坐标，两个天赋异禀的孩子双双找机会摆脱了大人的看管，一场争分夺秒的追击瞬间被触发。在马丁和露西拼了命搜寻自己那意志坚定、天赋异秉的孩子时，他们意外挖掘出了关于卡尔文那位大脑受损的哥哥的一些关键情报。同一时间，身处墨西哥的吉列尔莫在向一位神父坦白了自己犯下的滔天罪孽后，不得不面对一个极其残忍的抉择。

经过整整三年对阿米莉亚徒劳无功的搜寻，露西积累的绝望与怒火终于达到了爆发点。当她决定凭着自己的意志对卡尔文采取强硬措施时，卡尔文开出了一个闻所未闻、堪称荒谬的换人条件。就在马丁和杰克四处寻找失踪的露西时，他们赶到了布瑞克威尔公司，请求特雷弗协助。同一时间，吉列尔莫依然因不久前在墨西哥犯下的罪孽而心神不宁，后来他在亚利桑那沙漠中行走时，偶遇了一个失去一切的徒步男人，并因此做出了足以颠覆其一生的决定。

在一个洛杉矶罕见的暴雨之夜，马丁和杰克赶往布瑞克威尔公司，向马丁那些经过风浪的老朋友、老牌前海豹突击队员达奇求助。当大楼里的灯光突然全部熄灭时，众人本以为只是风雨闹腾的意外，可谁知真正的地狱随着吉列尔莫闯入公司内部而瞬间洞开。在争斗趋于白热化、不少人接连丧命的生死关口，杰克在捍卫自己生存的最后关头，被证实具有能与阿米莉亚沟通的极端关键能力。

在布瑞克威尔公司恶战带来的风波精疲力尽地告一段落后，马丁、露西和杰克跟踪并找到了在托尼·里格比家外徘徊的卡尔文。马丁一把揪住卡尔文的领子，逼他协助锁定阿米莉亚的下落。随后众人回到卡尔文的阁楼，在那里，卡尔文将阿斯特公司针对阿米莉亚的真正企图全部抖了出来。与此同时，杰克主动接驳上了一台精密的脑部扫描仪——扫描得出的结果不仅更进一步揭示了阿米莉亚的踪迹，还给了卡尔文用来与脑死亡的哥哥进行沟通所赖以突破的最终一块拼图。

在杰克给出的暗码指引下，马丁追查到了一名叫作菲利普·格林的男人，并由此得知格林先生竟然就是特勒医生这辈子接触过的第一个病人，他如今正因为杀害三名阿斯特公司员工而被关在死囚大牢。距离格林被行刑没剩几个小时了，马丁飞速赶到监狱试图寻找答案，但格林威胁拒不透露任何信息，除非马丁能帮助他在死前见到了已经疏远多年的女儿凯特·戈登医生。当残酷的倒计时滴答作响、人命危在旦夕之际，这些数字还能否指向生路？

当杰克用一套密码搜索阿米莉亚的行踪时，马丁则沿着一条血迹斑斑的路径找到了吉列尔莫，这个杀人狂正在暗中跟踪身为“三十六义人”之一的奈儿·普林顿医生。与此同时，卡尔文会见了阿斯特公司那位手段极为高杆的CEO妮可·法灵顿。为了能软硬兼施地将卡尔文再度诱回公司效力，法灵顿向卡尔文展示了人类的第一台量子计算机。当不同的道路最终通向同一个终点时，震撼人心的意外接连爆发，鲜活的生命也在这一系列连锁反应中骤然消逝。

马丁决定赌上自己的全部，主动打破被动逃亡的局面。他将一切真相向负责此案且一直心存怀疑的朗格警探和盘托出，试图以此洗刷强加在自己身上的罪名。结果，朗格警探随即将这起调查的规格层层升级，并向该案的重要角色发布了全境通缉令。另一边，杰克引领着阿夫拉姆不断接近一位有可能是“三十六义人”之一的关键人物。在卡尔文不久前私会了阿斯特公司高管妮可·法灵顿之后，他们背后那邪恶的图谋再度加速，而现在唯一能出面阻止这一切的，只有马丁了。

随着阿斯特公司的季度财报发布日日渐逼近，高管妮可·法灵顿变得愈发狗急跳墙，而公司对“三十六义人”的持续研究能否收网，全都压在了卡尔文的成果之上。在与阿斯特公司的执法打手坦纳发生了激烈的正面冲突之后，马丁与特雷弗·威尔科克斯共同制定了反制计划。特雷弗压上了自己的身家性命，作为一名卧底潜伏了进去，誓要阻止利令智昏的公司高层为了无限的贪婪而去残害那些无辜受困的测试者们。

阿斯特公司离最终完成足以让其在全球经济游戏里登顶封神的数字序列，只有一步之遥了。已经杀红了眼的高管妮可·法灵顿不顾一切，将刚刚被掳走的杰克和阿米莉亚作为她的两名新测试样本。另一边，马丁与特雷弗正紧锣密鼓地执行着自己的严密行动，他们靠审问捉住的公司狠角色坦纳来寻找突破口。随着杰克和阿米莉亚被置身于整场惊天危机的绝对正中心，马丁必须顶着巨大压力与时间展开殊死角逐，去拯救他们并阻止阿斯特公司彻底改写人类的未来。