1999最终章6部曲

地球防卫军的总指挥古桥参谋往宇宙进行友好计划，在太空船内离奇被杀，而其他工作人员亦不幸遇害，外界对于这宗事件诸多揣测…… 继任的加持参谋态度嚣张，不但声称古桥参谋是死于叛变，还扬言要解散超人警备队……为了查明真相，超人警备队的队员四出奔波，寻找外星人杀人的证据，事情快要水落石出了，外星人竟借用了队员风森的身体，要胁赛文奥特曼就范，为了拯救全人类，赛文奥特曼会否就此牺牲风森的性命来成全大局？从此，风森的命运将会如何被彻底改变？

超人警备队的里美回到故乡，无意中发现了一本描写“大铁人”秘密的书籍，多年前她爸爸为了出版这本书被外星人所杀，今天 里美再与写这本书的叔叔重逢。 原来书中所述的大铁人就是当年叔叔精心研制的宇宙船，它拥有超越宇宙一切人神的无比威力。这个秘密被敌对的外星人知道了 ，于是便把制造大铁人的上册书抢走，照样制造出一个人类难敌的 “大铁人”，企图毁灭地球……里美的叔叔为了拯救一切，决定走进大铁人的身体裡，希望用自己的正义思想，与大铁人二合为一，制止它继续破坏……赛文奥特曼与大铁人展开大激战，叔叔是否会坚持留在大铁人体内与它共存亡？

外星人恐怖分子拿著一种称为“菠萝蛋”的化学武器来到了东京，目的是在地球试验这种武器的威力。超人警备队今次的任务，是要在东京找出外星人的踪迹，并把“菠萝蛋”一併毁灭。队员水野最近恋上了一个貌若天仙的女牙医，在毫无防御的情况下，跟随她到了一个奇怪的货仓，在那裡，水野发现了“菠萝蛋”，这位令水野神魂巅倒的美女终于露出了真面目……在爱情与地球的存亡两者之间，水野将会如何取捨？赛文奥特曼又会如何把外星人的阴谋粉碎？

在超人警备队阿岛队员的故乡，有市民目睹一条古老的村在刹那间出现，又在瞬间突然消失了……根据研究，有可能是外星人运用“得奇粒子”的能量，令时空产生变化，把已成历史的老村庄重现眼前，产生时光倒流的现象……村中一位老伯的手掌上，有几度神奇的贝壳伤痕，时光倒流，把这位老伯带回历史之中，揭开了一幕幕感人的往事……故事中男主角背弃盟誓，一去不返，现在是女主角报复的时候了。到底外星人跟这个故事有何关係？赛文奥特曼又会如何对待外星人？

在东京出现了一些可以实现人类愿望，甚至复制人类思想的神殿石柱。据说这些石柱，本来已一万多年沉没于海底，今次再现，原来又是外星人策动的计划。他们把人类的思想複制到石柱去，然后再把思想转为讯号，利用这些讯号操控机械巨兽，于是地球的 存亡与否，便决定于人类本身思想的好与坏了。一位少女不满父亲无恶不作的所为，于是向石柱许愿，把父亲邪恶的思想吸掉，结果，唤醒了巨兽邪恶的慾念 ，在地球到处破坏……赛文奥特曼为了拯救人类，又要和外星人周旋到底了。

在几百万年前，地球原本是外星人的故乡，人类残暴的祖先在地球进行杀戳把这地方鹊巢鸠佔。而世代以来，所有统治者还一直把纪录了这个秘密的“亚米加档案”禁敝起来，不肯承认过错。事实上，外星人直对地球虎视眈眈，并非因为要侵略，而是想讨回公道。这次，外星人决定实行最大的报复行动。即使地球高层最终决定向宇宙公开承认“亚米加档案”的内容，但是也按制不住外星人为国复仇的决心。作为地球的好朋友，赛文奥特曼不忍袖手旁观，但是从宇宙公义的角度看，他理应主持公道……赛文奥特曼将会如何抉择？