第 2 季

50亿零23年后的新地球，新生的博士和罗斯来到了一个位于M87 银河系的新地球，在那里罗斯被人（或者说是人皮）附身。新地球原来的居民――长着猫脸的人为了治疗人类移居到这个星球时所带来的种种疾病，用自己的身体细胞培养人体，关在密室中做病毒实验。有一个传说：Boe之脸会在临死前会对一个孤单的旅行者说出他最大的秘密，博士见到Boe之脸，但后者告诉博士，下一次见面的时候就是说出秘密的时刻。

博士和罗斯阴差阳错地回到了十九世纪的苏格兰，在那里他们将遇到维多利亚女王，以及传说中在满月时出现的狼人。女王逃过一劫后决定针对超自然现象与外星人事务设立火炬木研究院 (Torchwood Institute)。

2006年英国伦敦，博士和罗斯以及米奇·史密斯(Mickey Smith)来到了某学校，博士发现，这里的学生拥有超时代的知识（如何超越光速等），而大部分学生被一群大蝙蝠变化成的老师（克里烃人）控制着，在用电脑破解创世密码，想要控制整个宇宙。（博士的旧伙伴莎拉和King Dog出现）

18世纪的法国，凡尔赛宫遭受到时钟杀手的攻击。路易十五的情妇，蓬皮杜夫人，呼唤她梦中的神秘男子—博士 。

2006年英国伦敦，博士、罗斯和米奇意外来到平行世界的21世纪，在那里他们发现这是一个从未见过的21世纪，罗斯发现她的父亲皮特·泰勒还活着，并且帮助约翰·鲁米克制造了一个人类升级工厂，开始人类佩戴工厂制造的耳机下载任何资料。可是鲁米克却要将人类改造成人造人。但是，改造后的人类，却变成了一个新的种族——赛博人(Cybermen)。

2006年英国伦敦，赛博人与人类，还有来自另一个21世纪的博士、罗斯和米奇，将开始一场精彩的战斗。

1953年英国伦敦，博士和罗斯在50年代的城里，看到人们在买电视机，准备收看伊丽莎白的加冕典礼。在柯浓里的家里，博士和罗斯发现一个没有脸的妇人被警察带走了，博士为了要知道真相也去了警察局。而罗斯看了看柯浓里家的电视机后，好像发现了什么便去调查。但随即罗斯也被警察局发现在大街上，并且也没了脸。

四万三千年后的太空基地，博士和罗斯来到了未来的太空基地。他们看到了有一群名为无德 (Ood) 的外星人给在太空基地工作的人们做奴仆。太空基地是建在一块巨大的岩石上面，基地外面竟有一个巨大的黑洞。在一次小地震后，部分太空基地和塔迪斯塌陷了，博士为了寻找塔迪斯决定到地底去看一看。

四万三千年后的太空基地，被邪恶力量控制的无德 (Ood) 包围太空基地，基站里的队员决定带着罗斯离开太空基地。而留在地底的博士将会看到一个巨大的魔鬼。

2006年英国伦敦，埃尔顿和一群好朋友出于好奇心，在图书馆地下室建立了一个小团体，专门收集一些有关博士的资料。但是在维克多·肯尼迪加入后，有人发现他们的伙伴越来越少了。后来埃尔顿发现原来维克多是一个外星人，而博士和罗斯会出现吗？

2012年英国伦敦，博士和罗斯来到了6年后的伦敦，当时的群众应该准备迎接，第30届伦敦奥运会的开幕。但是博士和罗斯看到在某条街道上的人，不明原因地一个个的消失。然后博士和罗斯来到一个小女孩克洛伊的家里发现，不知什么原因，克洛伊画的人和消失的人一样。博士经过调查后知道了，原来是一种外星植物进入了克洛伊的体内，所以克洛伊画的人会在街道上消失进入画中。

罗斯和博士回到现在的伦敦，发现满大街都是幽灵。火炬木小组(Torchwood)的女指挥伊冯·哈特曼，因为一个用机器无法测量到任何数据，只有肉眼看见的大球在金丝雀码头出现，便在大球出现的裂缝处建了大厦，并且控制裂缝使鬼魂出现。但所谓鬼魂实为赛博人，赛博人趁机入侵火炬木，打开裂缝引入赛博大军。而那来自零空间的大球实为一个通道，里面出来了四个戴立克。

接上一集，赛博人宣称已统治地球，并要移除人类的恐惧、性、阶级、人种和信条，把所有人类都变成赛博人。而四个戴立克保护着同样从大球里出来的“创世方舟”，并扬言一个戴立克就能摧毁五百万赛博人。平行世界的罗斯的父亲皮特，米奇也都通过裂缝来到这个地球加入了战争。“创世方舟”是时间领主制造的监狱，内关有数百万戴立克，一场恶战开始，人类面临灭绝。博士逆转裂缝把赛博人和戴立克关进零空间，罗斯被“父亲”接去平行世界无法回来，博士引爆了一颗超新星以获得足够能量穿越时空，向站在恶狼湾的罗斯道别；火炬木小组第一分组全部覆灭。