第 1 季

在一种病毒消灭了大部分人类的27年后，科学家们派一个人回到2015年，以阻止瘟疫的发生。Cole的唯一线索是一位病毒学家，他知道疫情爆发的危险来源。

一个名为 "十二猴子军 "的神秘组织的线索将Cole引向2015年的一家精神病院，那里的一个病人掌握着毁灭世界的瘟疫的关键。同时，尽管有人警告说她的参与可能会扰乱历史的进程，Railly博士还是冒着生命危险来帮助他。

Cole寻找病毒的位置，把他带到了2014年，也把他带到了Railly博士生命中的一个毁灭性的时刻，涉及到海地的一次危险爆发。

当一伙追捕Cole和Ramse的危险掠夺者威胁到拯救过去的任务时，一场为未来而战的战斗随之展开。

Cole和Railly博士在发现 "夜间房间 "时与 "十二猴子军 "对峙。"夜间房间 "是一个非现场的秘密实验室，存放着有一天会毁灭世界的病毒。

当 "夜间房间 "的悲惨事件在2043年创造了另一个现实时，Cole拿他的未来冒险。

Cole、Railly博士和Aaron努力阻止病毒被作为生物武器部署在车臣。

为时间机器提供动力的 "核心 "正在消退。为了让Cole从过去回来，Jones必须说服她在军事行动 "矛头 "的前同事，她的任务是值得拯救的。

Cole发现自己在2017年处于瘟疫的高峰期。由于没有选择，Jones面临着取代核心的不可能的选择。

当Ramse为保护他新的家庭而不惜一切代价时，各种力量就会爆发出来，让Cole来处理后果。

Cole分裂到1987年的东京，为阻止十二猴子军做最后的努力。

Cole在时间旅行的影响下奄奄一息，Railly必须找到一个能拯救他的人。

Cole和Railly试图与他们最亲密的敌人进行最后的对抗，而Jones则面临着对她所取得的一切的新威胁。