第 1 季

叫艾丽亚的女人给了失忆男人一副神秘的眼镜，并请求其拯救这个世界。只知道自己是“DEUS”特工的JIN和相同身份的K一起追捕计划侵略地球的外星生命，但就在这时，巨大外星生命体迦尔基梅斯出现了，在生死攸关的时刻JIN取出了那副鲜红色的眼镜……

那夜，惠理子很着急。对出租车司机留下一句“船要出发了！”接着事件发生了。据说有未确认飞行物体绑架人类。接到DEUS指令的JIN和K立刻开始调查。JIN很在意三天前的夜晚在酒吧遇到的神秘男子所说的话，开始追赶他。他到底是什么人，还有船到底是什么，与这个事件有什么关系呢……

街道上发现脑异常收缩的尸体。，个男子叫了声“HOPELESS”……接到DEUS指令，JIN和K一同任务。但是调查的地方，就是昨天见到田丸的公园。田丸说了句“干得不错哟”让JIN等人产生不信任，开始对那男的进行拜访和潜入调查。在那里，他们见到了前所未有的巨大机械……

在街上，人们突然变成木乃伊化死亡事件相继发生，JIN和K，一同和从事潜入调查的S，立刻展开调查。死于非命的被害者，最近都有购买一种叫Shiner05的Chemical（技能性化学药品）。开发这种商品的公司社长田崎所隐藏的黑色箱子的正体是……

确认到未确定飞行物体落下，采了残留在坠落现场的血液进行分析，侵入的外星人，受到同星系别的外星人的侵略，知道作为承担自己星球的地球被外星人朋友批评的事。被确认死亡的他们已经融洽了地球人的生活，在酒店和中华料理店打工且没有危险性。但是确认到新的像野兽一样的外星人飞来了，事态正朝着意想不到的方向……

在IT企业工作的高雄，被每天的工作追迫的疲惫不堪。离开公司顺路去亚里沙的酒馆，每天抱着对宇宙的妄想。某一夜，不明飞行物的光之魂被确认，并且攻击人的事件相继发生。正追逐去向的JIN想见一下同样失去记忆以前的朋友高雄。但是，终于对公司厌烦，回到家的高雄面前,出现了那个光之魂……

在对飞行物体入侵调查的K，追着作为入侵者的外星人崴罗星人的时候，遇见了难以相信的男人。他，曾经是和S同组因任务而殉职的原特工D。他的过去到底发生了什么？他不是早在几年前与S执行任务时殉职了吗？另一方面，JIN来到公园一名弹木吉他的女性奈多流遭遇崴罗星人袭击的现场。知道了她真正的原形是……

接连发生毒品工会的贩子遭袭杀人事件。罪行都在雷雨之夜进行，据目击者称犯人是穿着红色大衣的杀人魔。在现场留下的难以理解的血字成为了破案的关键。某夜，贩子们遭到红色大衣的杀人魔修布纳斯的袭击！另一方面，县京介和麻美夫妇过着幸福生活。然而，门口却挂着那件红色大衣……

明天将面临百年一次的月全食，穿白色礼服的女性被兽人袭击的事情却接连发生。民俗学研究室的尾行，说百年前的月全食的那年，也同样有兽人事件发生。鹭乃宫家女儿真昼被袭击的那夜，和在这家滞留的外人望的失踪有什么关系！？应该已经消失了的百年前的望远镜映出了红色的月亮！月全食终于开始了……

由于陨石落下的影响能朱湖被封锁了。这个报道让失去记忆片段的JIN前往那里，并从遭遇到的正在逃跑的自由记者榛原那里得到了存储芯片。但紧接之后榛原就被政府射杀了。对政府的行动而产生怀疑的JIN，开始探访榛原的朋友早纪，曾一起管理监视政府机关情报局的秘密的人。存储芯片里到底是什么内容？和JIN的记忆有什么关系？！

JIN等人的搜查，进展到了将绝密背后的「AQUA PROJECT」的全貌判明了。但是这个计划没有实现，据说在3个月前被冻结了。不可理解的是，在这几天这个计划的相关人员，一个个失踪了。一切似乎正是从3个月前为开端。正在逼近真相的时候，艾丽亚将JIN他们3人一起卷入到了自爆之中！？

有利用「AQUA PROJECT」图谋邪恶计划的人。相信艾丽亚所告知的真相，并且被指名应该完成拯救世界，开始行动的JIN他们。眼前出现了阻止古拉奇艾斯的群体，ULTRASEVEN X陷入苦战！到底胜利的时候来了吗？以及，包围这个世界迷一样的黑暗化解了吗？JIN、艾丽亚，K和S的明天究竟……