第 2 季

六十年代初期，正在中国被三年自然灾害折磨得千疮百孔时，又遭到了苏联的反目，危难时刻，朋友变成了敌人，伺机已久的国民党也隔海向大陆伸来了反攻的魔爪。此时的安在天，在苏联向破译大师安德罗学习破译密码技术。安在天惜别了相处四年的老师安德罗，奉命归国，一同归来的还有妻子小雨的骨灰。北京总部，铁院长已经成为总部的副部长，金鲁生也随他调到总部工作，安在天本人也荣升为701的副院长。铁部长告诉安在天，目前台湾国民党的反攻趋势严峻，蒋介石正在大搞“光复大陆”的阴谋，同时启用了一套新的联络新密码——光复一号密码。将安在天紧急召回就是为了破解该密码，安在天顿感难担重任。情报处柳处长告诉安在天，光复一号密码的原身就是美国的“世纪之难”密码，出自于一个名叫斯金斯的苏联顶级密码师之手，安在天顿感不妙，因为斯金斯曾是安德罗的同学，他深知以701的实力，破解斯金斯的密码绝对不可能。安在天提出在数学界寻求援助，铁部长批准了。数研所孙书记接到了迎接安在天的指令，立刻在招待所恭候，几经周折终于和安在天碰面，将安在天安排在安全的301房间，袁处长为暗中保护安，住进了对门。孙书记按安在天的要求从数研所中选择了7个数学专家参加安在天的选拔考试。清晨，安在天在食堂，在一个漂亮女人大胆的凝视下，吃完了早餐。回招待所取试题时，那女人早已在院中恭候多时，此人就是黄依依。32岁的黄依依是留美归国的数学博士，但考试人选中并没有她，黄依依向安在天大胆地要求参加考试。选拔考试已经开始，黄依依在招待所的房间中向安在天争取考试资格。谈话中，黄依依偶然见到了考题，顿时一改常态，专注的样子令安在天对其产生了兴趣，决定给黄依依一个考试的机会。安在天向孙书记打听，得知黄依依曾是美国顶级破译家冯·诺伊曼的手下，在国内的数学界享有盛名，但由于生活作风问题，没有成为此次选拔的人选。

黄依依短时间内准确地做出第一道考试题，更令安在天难以置信的是，她竟然能丝毫不差地预测出7名参考人员的答题情况。安在天决定让黄依依将第二道题继续做完，但孙书记的出现打断了他们的谈话，黄依依空手告辞，但心中已经记下了考题。孙书记向安在天推荐谢兴国为最佳人选。谢兴国来到安在天的住处面谈，在安在天精心设计的心理测试中，谢兴国暴露出软弱的性格缺陷。黄依依找安在天，气愤地道出第二道考题的玄机，猜出安在天的特工身份。此时安在天已经确定黄依依曾经干过破译工作，同时暗自决定她就是最佳人选。安在天向孙书记调取黄依依的档案，书记以黄依依作风不正、放荡不羁的理由予以阻挠。但安在天心意已决。而就在这时，黄依依被谢兴国的老婆打了。黄依依约安在天在咖啡馆见面，她以为安在天不知道她被打的事。铁部长收到“光复一号”的破译资料，并请来曾多次破译出美式密码的专家胡海波，希望他能前来协助破译“光复一号”。与此同时，铁部长接到了一个令他难堪的电话，有人告发安在天和黄依依有暧昧的关系。安在天在咖啡厅里认识了林姐和谢耶夫，黄依依不知道安在天去过苏联，用俄语对林姐透露出对安在天的爱意，全然不知安在一旁听得一清二楚。安在天一心想跟黄依依谈正事，黄依依却要他和自己跳舞，安在天无奈，只得留下一瓶从苏联带回来的止疼药，先行告辞。

铁部长已经得到安在天要带回黄依依的消息，并决定见一见这个颇有争议的黄依依。胡海波自言难以胜任“光密”的破译，并给铁部长推荐了一个破译密码的人选——张茜。黄依依和安在天在招待所院子里少不了一通撕扯，当安在天提及要将黄依依带回701时，黄依依竟然一口回绝。安在天强拉她上车，黄依依竟对着他的手背狠狠地咬了一口。路上，黄依依看着安在天被自己咬伤的手背，又拿出他送给她的那瓶止疼药，细细地为他抹了起来。安在天哭笑不得。总部门口，看到黄依依另类的打扮，站岗的哨兵认为她是“女特务”，差点儿将她抓了起来。见到铁部长，黄依依依旧一脸不高兴，冷若冰霜，不料，胡海波竟然一眼认出黄依依就是他推荐的那个人——张茜，两人都被这突然的相遇而惊呆了。胡海波给铁部长出谋划策，要想让黄依依欣然配合工作，首先必须在心理上压倒她。铁部长和黄依依单独谈话，并单刀直入地让黄依依提条件。黄依依见反对无济于事，便提出了要求：破译密码后必须允许她离开701，同时还故弄玄虚地要求离开时要带走一个人。铁部长答应。临行前，黄依依和安在天一同挚诚地拜过祖冲之的雕像。安在天连同黄依依带着光密的资料，登上了返回701的飞机。飞机上，热情的黄依依已经开始了对安在天火辣辣的爱情攻势……701已经迁址大西北。大漠驼铃，黄依依看到了不一般的风景，激动不已，和安在天一起对着天空大叫起来。此时，701徐院长已经为迎接黄依依的到来作了充分准备。众目睽睽之下，黄依依熟练地打开了装有“光密”资料的铁箱，取出斯金斯制作的商业密码机，三本她的专著，和国民党三军连以上军官和地方各大国务、警务部门科以上官员的花名册，众人喜出望外。无意间黄依依知道了安在天曾在俄国生活过，回忆起咖啡厅和林姐说过的话，顿感羞愧难当。

演算室内，黄依依和安在天比赛打算盘，两局下来，黄依依一负一平，一向以算盘高手自居的黄依依，竟然败在了安在天的手下。聊天中得知，黄依依就是凭借打着一手好算盘而成为了冯·诺伊曼的手下，而安在天也因为临时抱佛脚，用算盘争取到去安德罗身边工作的机会。二人都为彼此的才智所折服，惺惺相惜。安在天带黄依依拜访破译处长陈二湖，路上一再叮嘱她，在陈二湖面前要毕恭毕敬，但二人见面，黄依依却没有丝毫收敛，陈二湖也针锋相对，舌战后，黄依依反而要求陈二湖参与此次破译工作。安在天极为不解，黄依依告诉安在天，密码的成功破译需要有人坠入陷阱，其他人才能绕开陷阱，而陈二湖就是这个“替死鬼”。安在天不以为然，他认为这是一种类似乒乓球比赛一样的团队精神。夜晚，安在天独自在家对着亡妻的灵台诉衷肠，黄依依来访，无所顾忌地表达对安在天没有保留的爱和欣赏，使安在天在亡妻面前无地自容。但似乎黄依依并没有气馁，她反而认为爱情给了她机会。

特别行动小组首次开会，陈二湖被任命为组长，黄依依却无故缺席，安在天叮嘱黄依依的助手小查将会议内容传达给她。小查到处寻找，只见黄依依正在小树林里逗树枝上的小松鼠。小查提醒黄依依去上班，两位女子谈话投机，很快成为了朋友。黄依依以安在天的身份给安德罗写了一封信，希望安在天能够寄给安德罗，从而了解关于斯金斯的个人资料。黄依依研究发现，斯金斯研制的这部商用密码机是照搬二战时期德国著名的英纳格码，安在天恍然大悟，他们为斯金斯的无赖行为感到气愤，同时更觉得斯金斯的密码莫测难破。转眼间，一个月过去，破译小组的人都在埋头研究密码，黄依依却只对两件事情感兴趣，上班时间在破译室里面琢磨木头模型，下班时间去喂小松鼠，研究没有丝毫进展，她的办公室不允许除小查外的任何人踏入一步。没事时候，就去和警卫连的战士下棋，赢回很多战利品——鲜花。与此同时，陈二湖发现敌人情报数量骤增。黄依依对安在天的爱有时又有些象小孩子过家家，因为安在天无心说出的一句玩笑话，她竟负气上了沙河，差点儿跌入沙坑里。就在生死瞬间，是安在天及时赶到，才救下她一命。于他，是做人的本能；于她，却认为是他爱自己、愿意生死相许的表示。

黄依依利用四封密信做成了一个密码游戏，巧用密码游戏和安在天一起推测“光密”的加密技术，同时她还暗示安在天自己的心事就在这部密码游戏中，随着安在天将密信一一解密，四个赫然大字映入眼帘——我很爱你。安在天对于徐院长关于他个人问题的劝说，始终无动于衷，他告诉徐院长：首先，他深爱他的妻子小雨；其次，目前一切事情都要为光密让路。安在天找到黄依依委婉拒绝了她的情感，黄依依对于安的行为无法理解。黄依依的梦给了她制作筛状密码机的启示，很快付之行动，不再琢磨几何模型，而是抓紧时间制作了一个筛状密码机。虽然黄依依的猜想被陈二湖否定，但安在天仍然从中看到另一条出路，并决定投入全部人力验证黄依依的猜想。包括黄依依、安在天在内的所有演算人员，在一个月内为这个猜想投入了全部的心血，然而结果却是猜想错误，黄依依疯了一般哭着冲出了演算室。一场算盘大战，曲终人散。

黄依依独自落泪，安在天悄悄来到她身边，鼓励她“做一颗铜豌豆”。二人在互相安慰中恢复了勇气，再次鼓足了信心。脆弱的黄依依借机再一次跟安在天表白，安在天仍然对爱选择了逃避，然而黄依依却愈发被爱情的火焰烧得失去了理智，她夜里来到安在天家，向他表达了苦恋之情，安在天冷漠的拒绝让她绝望，最后，黄依依留下一张“安在天，我恨你”的纸条，离开。失魂落魄的黄依依独自蹲在暗影中抽泣，被701所培训中心的汪林主任送回了家。次日，黄依依没有按时上班，安在天命人找遍了701却不见她的踪影，情急之下，安在天和小查来到黄依依的房间，发现黄依依已经昏迷在床，不省人事。安在天立即把黄依依送往医院。卧床在家的黄依依，被心病折磨得茶饭不思。在激烈的心理斗争后，安在天终于出现在黄依依的家门口，黄依依假装冷言讽刺，安在天不动声色，一盘棋缓解了尴尬的气氛。黄依依再次提起对安的爱恋，安在天却淡然表示一切都要为“光密”让路，包括安葬亡妻。

安在天结合工作成果，改变了破译敌人密码的工作方法，立刻取得成效。陈二湖很快破获了一份敌人的急电。然而例会上，黄依依却对不以为然，老陈愤怒离去。安在天给安德罗的信不见回复，他出差去了北京。已婚的汪林借找黄依依下棋之机亲近她，黄依依在对安在天的感情苦苦无果的情况下，百般失意，酒醉中和他发生了关系。不久，关于二人的小道消息便传开了。很快安在天从北京返回了701，他带回了关于斯金斯的资料。斯金斯的资料给黄依依很大的启发，对“光密”的制作有了新的猜想。陈二湖将黄依依和汪主任的不正当关系告诉安在天，安在天大怒。在徐院长的办公室中，汪林痛哭流涕地坦白了和黄依依的关系。安在天等人开会决定，将汪林撤消干部职业，开除党籍，保留公职，送去后山农场放羊。安在天提出要保护黄依依的声誉。

安在天意外收到了汪林的信，信中坦言，自己在黄依依的眼里，只是他的替代品。黄依依得知汪林东窗事发，深感对其亏欠，向安在天请求和汪林一同受罚，不料却遭厉声斥责，一气之下黄依依决定离开701。黄依依为表离去的决心，将自己苦心研究的“光密”资料交给安在天，同时，她任性的言语气得安在天手脚冰凉。陈二湖研究了黄依依提供的资料后发现，此资料对于他们来讲如同天书一般，黄依依在此刻绝对不能离开。可就在此时，绝望的黄依依在宿舍割腕自尽，大量失血加上血型特殊，让整个701人束手无策。最后，是疯子江南为她输血，挽救了她的生命。为了留住去意已决的黄依依，安在天采取缓兵之计，暂时留住了黄依依，答应汪林的处理问题由她做主，条件是必须破解光密。

工资很高的黄依依竟然向安在天借钱，她买来香烟，让小查十分不解。星期天一早，黄依依穿着长衣长裤和胶鞋，戴着草帽，背着一只军用挎包和水壶，悄悄地出了后门。小查向安在天汇报了黄依依的可疑行迹。汪林见到黄依依喜出望外，在窑洞里欲和黄依依亲热，而黄依依此刻对汪林却完全是怜悯之情，她所作的一切都只为补偿汪林。安在天连夜来到黄依依家中，责备她的做法会影响工作，却被黄依依任性狂妄的反驳击败。为了黄依依能够安心工作，安在天只得再次求助徐院长，徐院长命令阻止汪林和黄依依见面。黄依依如约来到窑洞，却不知汪林此时已经被接到命令的警卫阻止在农场中，不得外出。黄依依恍然大悟，像丢了魂一样，跌跌撞撞地往回走，安在天开车来接黄依依，却看到沟壑中踉跄而行的黄依依已经处于半昏迷状态，安在天赶忙将她送往医院。黄依依全身心地投入到破译光密的工作中，安在天的启发令黄依依如获至宝，寻找到攻破光密的新思路，从而使破译工作突破了困扰已久的瓶胫。

忙中偷闲，小查拉着黄依依搭班车进县城，不料狭路相逢张国庆的老婆刘丽华，因为一个座位发生了口角，刘丽华出言不逊，令黄依依初次领教了这个女人的厉害。更传奇的是，留在家里的张国庆一觉醒来，发生公文包被打开了，丢失了几页文件。701大肆出动，终于摸清是张国庆的儿子张建设因为调皮，将文件折成“飞机”， 扔进了山谷里。这个举动给张家带来巨大的变动，张国庆被贬为清洁工，刘丽华带着儿子离开了701，返回乡下。黄依依终日闭门工作，废寝忘食，再次做出了大胆的猜想，破译小组紧锣密鼓地开始演算，求证黄依依的猜想，这一次黄依依成功了。她破译了光密！光密的破译，使潜伏在大陆的台湾特务接二连三露出了他们肮脏、鬼祟的尾巴，公安人员频频出击，大批特务纷纷落网，从而极大地打击了一度嚣张的特务活动。黄依依和安在天双双荣立一等功。庆功会上，黄依依提出把汪林带走的要求，领导大吃一惊，安在天则无语。二人苦涩地告别，安在天准备回上海安葬小雨。临行之前，他告诉了她真相：是自己杀害了妻子小雨。

安在天上海归来，意外地发现黄依依并没有离开701，相反她留了下来，并就任了破译处处长的职位。从徐院长口中得知，黄依依去后山农场接汪林的时候，发现汪林在她破译光密期间，又与邻村的一个寡妇好上了。她万念俱灰，得了一场大病。安在天知道情况后非常难过，也许这个时候，他才意识到自己怎样伤害了黄依依。他主动找到她，带给她从上海捎回来的礼物，不料却遭到了黄依依的拒绝，她表明以后二人只能是同志和上下级的关系。安在天失落了。张国庆当街大哭，他把即将寄给家人的25块钱丢了，黄依依见状赶忙凑了25元钱给他，张国庆对此感激涕零。为人敦厚的张国庆不忘报恩，每日帮黄依依打水、洗衣服，黄依依对张国庆心存怜悯，时常接济他。张国庆从心底深处感激不尽，对黄依依照顾得更加周到。黄依依找到安在天，请他帮助将张国庆的妻子调回701，安在天执拗不过，只好答应她。但他风闻刘丽华是个泼妇，担心有朝一日黄依依给自己招来麻烦。果不其然三个月后，刘丽华来到食堂对黄依依破口大骂，指责她勾引张国庆，安在天冲上前喝斥张妻无理取闹，保护了黄依依。徐院长找黄依依谈心，想帮她解决个人问题，黄依依苦笑着回绝了。小查陪黄依依一同来到县城医院看病，黄依依在厕所偶遇刘丽华。刘丽华拦住黄依依恶语相攻，黄依依靠在弹簧门边闭目不理，刘见状故意将弹簧门拉到最大，黄依依被弹簧门的惯力击倒，脑袋磕在下水道凸口，顿时不省人事。黄依依颅内出血，经过抢救挽回了生命，但变成了植物人。面对失去意识和知觉的黄依依，安在天毅然决定将她接回自己家，悉心照顾她，盼望能够用爱将黄依依唤醒，但这个希望最终也没有实现，1965年3月9日，黄依依永远停止了心跳……安在天妻子小雨的死因是这样：安在天在某国边境执行任务的过程中，小雨一直忠实地做他的助手。然而，行动暴露，面对爱妻小雨和国家的利益，安在天做出了痛苦的选择——放弃小雨的生命，安在天深爱的妻子就这样倒在了自己的面前。