第 1 季

神御藏一号(向井理饰)原本是一名制服员警，有一天发生拥有大量军火的歹徒从大楼朝外扫射的事件，也到当地支援的一号，为了拯救遭到枪击的警察同僚，扛起两张盾牌去保护对方，同时也让自己陷入险境。在枪林弹雨之中，由於歹徒还挟持了人质，因此就连拥有一流狙击手蘇我伊织(绫野刚饰)的SAT都无计可施。

成立後一直没有事件发生而无所事事的NPS队员，甚至还要求神御藏一号(向井理饰)去拜托由鹤(吹石一惠饰)办联谊。就在此时，打烊後的百货公司发生爆炸案，由於是人为爆炸，而且是使用塑胶炸弹，这让NPS队长香椎(大森南朋饰)有不好的预感。

为了让全国都知道NPS，神御藏一号(向井理饰)不只上电视，而且还代表NPS接受访问。不过特殊部队一直有保持神祕的传统，看到NPS这麼大张旗鼓的宣传自己，让SAT队员感到很愤怒。而且一号事前也没有告知由鹤(吹石一惠饰)关於自己的工作性质，看到电视才知道的由鹤也感到很生气。

NPS与SAT在郊外的训练设施进行联合训练，结果在第二天的训练之前，竟然发生在训练中扮演人质的横川秋(土屋安娜饰)，遭到恐怖份子挟持的意外。而且对方是之前在好几个案子背後主使的M(小田切让饰)，还要求神御藏一号(向井理饰)单独来救。

蘇我(绫野刚饰)从SAT转调到NPS，就在NPS成员替他举办欢迎会的时候，接到有高中生自杀的通知。由於最近的连续自杀案件，在自杀者身边都有一颗M之前也有使用的特殊子弹，因此怀疑本案与M有关。包括一号(向井理饰)在内的NPS成员，开始调查在背後怂恿自杀的真凶到底是谁。

古桥(池内博之饰)的儿子史郎(山田日向饰)突然来找他，原本史郎不肯说出理由，後来才知道原来是前妻即将再婚，以後可能无法再与古桥见面，因此史郎背著母亲来见古桥。後来古桥的前妻来接史郎，古桥送两人去坐车，没想到之後竟传出有巴士遭到歹徒劫持的消息。

古桥(池内博之饰)的前妻与儿子史郎，所搭乘的巴士遭到劫持，刚好与古桥在一起的一号(向井理饰)，马上与他一起去追巴士。後来巴士在隧道中爆胎停下来，好不容易追上的古桥，在队长香椎(大森南朋饰)的许可下，与歹徒开始展开谈判。

发生了名人小孩遭到绑架的案件，绑架案通常是由SIT负责，不过这次NPS也一起协助调查。因为这次的案件与2年前发生的绑架撕票案很类似，因此再度怀疑同样的嫌疑人。更令人惊讶的是，最有可能犯案的竟是NPS队员速田(平山浩行饰)的女友优子(平岩纸饰)。

蘇我(绫野刚饰)决定回SAT，突然得知这个消息的一号(向井理饰)等NPS的成员们，感到非常惊讶。不过队长香椎(大森南朋饰)已经找到一个新的狙击手来替代蘇我，令人惊讶的是，这名狙击手竟然是一名女性，叫做林伊琉真(新垣结衣饰)。

发生日本各界名人遭到绑架的事件，而且幕後的首谋是之前与NPS交过手的正木圭吾(小田切让饰)。後来正木还突然出现在一号(向井理饰)家开的食堂，并且打电话给一号。害怕正木会对自己的家人不利，一号马上赶回家中。