第 1 季

高中生侦探工藤新一（沟端淳平饰），青梅竹马兼女友毛利兰（忽那汐里饰），和毛利兰的父亲毛利小五郎（阵内孝则饰）在一个封闭的白色房间清醒，似乎被囚禁的三个人却并不记得被绑架。在房间的输入面板，有人自称是一个工藤新一的粉丝的人在墙上贴上了给工藤新一的挑战书。在输入面板里，显示了一个日期，还有一个“输入密码”选项。这个日期是摄影师坪内勇平（AKIRA饰）谋杀其妻子妹妹相田桃子（长谷部瞳饰）的一个案件，看起来“工藤新一的粉丝”是想让工藤新一通过这个案件推理出密码。

工藤新一努力地从白色密室逃脱，但是却进入了第二间白色密室。然后，第二间密室的显示面板显示的是一次发生在电视直播中的杀人事件。这一天，拥有超能力的鹫见治郎（冢地武雅饰）在一个电视直播节目中出现，而主持人原田孝之（菊池均也饰）却并不相信他拥有超能力。而治郎为了让大家相信他拥有超能力，决定用超能力杀死原田，而新一却并不相信超能力能杀死人。

新一在第二个密室输入密码后，又进入的第三个密室。面板上的日期是一个让小五郎很想忘记的日期。这天，酒吧陪酒小姐斉藤丽香（山崎真实饰）盗窃案隆重开庭。在法庭上作为证人证明丽香不在场的是小兰的母亲对的母亲妃英理（大冢宁宁饰）。妃英理好心为丽香辩护，却遭到了丽香的辱骂，于是妃英理用“空气抢”将丽香“杀死”，但新一却不认为是妃英理杀死丽香的。

来到第4个房间，日期显示的是小五郎策划的一次婚礼的时间。这天，小五郎的朋友本木结婚，由小五郎策划婚礼。新一被小五郎“聘用”为助理。新一在“工作”中发现本木与一个叫做娜娜的女生有外遇。在婚礼现场，新人收到了一个名为“偷吃我就杀了你”的祝福邮件。

高中生侦探工藤新一与毛利兰、铃木园子，一起到电影导演永田彰宏的别墅玩。当永田以指导演技为理由，与新进女演员沙织热吻时，永田的妻子，同样也是知名女演员的知里突然现身，而且还突然打了沙织一巴掌，于是两人开始产生激烈口角。为了要缓和气氛，永田邀请大家一起喝红茶。

毛利兰受母亲委托，与工藤新一一起到某间酒店，调查毛利小五郎是否在外面真的很花心爱玩。而就在此时，酒店突然开始举办游戏，内容是20名酒店小姐排排站，由两名客人每次各指定1-3名的小姐。先选到排在第20个的酒店小姐，同时也是该酒店第一红牌的久美，就可以得到久美的热吻当作奖赏。而这次参加这个游戏的是小五郎跟数学家峰正人，游戏进行得非常热烈，可是万万想不到最后竟然会闹出人命。

在大富翁拉面王野口兵五郎的告别式上，大打出手的姊妹花野口由利与妹妹野口美纪。与野口家是世交，同时也来参加丧礼的铃木园子，出面阻止两人打架。就在此时，毛利兰接到园子家里打来的电话，园子与由利竟然遭到绑架。新一与小兰偕同刑警马上来到野口家的公司，绑匪打电话来表示要求10亿圆的钻石当作赎金。

工藤新一与毛利兰搭公车时，碰到色狼泽田治对小兰毛手毛脚。小兰马上大喊色狼，而且还追泽田追下车。后来小兰与新一分头追人，好不容易才抓到泽田。正当要将泽田扭送警局时，看到一名因为呼吸器停止而病情危急的老人宫野胜代被送到医院，而刑警佐藤美和子等人则是怀疑这可能不是意外，而正在询问胜代的看护山下诚。

关西的名高中生侦探服部平次，为了合气道比赛而来到帝丹高中。工藤新一与平次虽然没见过彼此，在心里却把对方当成对手，可是表面上又装出完全不在乎对方的样子。后来平次在去帝丹高中的路上碰到抢匪，与毛利兰一起在回家途中的新一，也一起帮忙追抢匪。后来是靠新一踢足球击中抢匪，不过也同时打破一间民宅的玻璃，而里面还传出女人的凄厉尖叫声。

毛利兰在网咖与委托人水谷雪乃视讯，雪乃表示遭到男友久保健介家暴与跟踪，因为不知所措，所以找毛利小五郎商量。不过由於小五郎跑去看偶像演唱会，所以今天只好由小兰跟她视讯连线。可是就在两人连线途中，突然听到用力敲门的声音。虽然小兰一直劝雪乃不要开门，可是雪乃还是受不了去开了门，后来雪乃从画面中消失，只听到她的求救尖叫声。很担心的小兰马上找新一到雪乃的公寓去，可是在那里却只看到雪乃的血迹。

新一请小兰到米花中心大楼的高级餐厅吃饭，而且还表示有重要的事情要告诉小兰，可是却迟迟说不出口。就在此时突然传出有人尖叫，原来是在电梯里面发现一名遭到枪杀的尸体。死者是在同大楼开电玩公司的社长辰巳泰治。知道新一对杀人案很好奇的小兰，叫新一先去破案再说。当新一赶到现场时，警方已经到达，并且认为应该是为了抢钱而杀人。可是就只有新一认为案件没这么单纯。

在银行的出租保险箱里面，躺著银行员工园田真知子的尸体，而且外面的铁门还拉下，在外面还贴了一张报警就会引爆炸弹的纸。新一先将尸体跟室内的状况拍摄下来，并且要小五郎确认倒在里面的女子是不是真知子。小五郎表示突然接到真知子的电话，请他到银行来说有事情跟他商量，可是当他到银行时，真知子就已经倒在里面。

新一遭到某人绑架到白色房间，而且被迫回想起许多过去发生的案件。新一好像突然想到什么，对著小兰说”这一切都是你做的”。可是就在此时，两人突然被玻璃隔开，房间里放出白色的烟雾，不久后两人都失去了意识。当新一醒来的时候，已经离开白色房间，而且在现场有很多警察。第一个反应就是要找小兰的他，却发现法医站在小兰身边，而且后来还告诉她小兰已经死掉的消息。